1个油茶Y_2SK_2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测.pdfVIP

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2017-10-22 发布于上海
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1个油茶Y_2SK_2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测

第 44 卷第 10 期林业科学 Vol44 , No10 2 0 0 8 年 10 月 SCIENTIA SILVAE SINICAE Oct . , 2 0 0 8 1 个油茶 Y SK 型脱水素的全长 cDNA 2 2 克隆及生理功能的预测胡孝义　谭晓风　张党权　曾艳铃　陈鸿鹏　田晓明　刘　巧 ( 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室　长沙 410004) 摘　要 : 　以构建的油茶 EST 文库为基础 ,采用电子克隆技术 ,分离克隆一个脱水素基因的全长 cDNA 序列 ,该基因的 cDNA 全长 1 406 bp ,含一个 600 bp 的CDS ,编码 200 aa 的小分子蛋白。推测该基因编码蛋白的分子质量为21 ku , ( ) 等电点 7 ,暂命名为 CoDHNI 。同源性分析发现该基因的编码蛋白具有 2 个 Y - 片段 DEYGNP , 1 个 S - 片段 ( ) ( ) SGSSSSSS ,2 个 K - 片段 KIKEKLPG ,属于典型的 Y SK 型脱水素。经Blast 比对 ,发现富含苏氨酸的 Thr - 区在各 2 2 物种间变异显著 ,推测该区为油茶所特有 ,有利于在被保护的大分子表面形成水合层 ; 同时还发现一个十分保守的基序 : EDDGQGGRRKK ,可能有利于脱水素的磷酸化和亚细胞定位。通过与柑桔和拟南芥的脱水素比较 , 提出 CoDHNI 有可能缓冲种子脱水胁迫响应时钙离子的瞬时增高 ,并可结合重金属离子 , 以减轻活性氧的危害。关键词 : 　油茶 ; 脱水素基因; cDNA 文库 ; RACE ; 生理功能 ; 生物信息学 ( ) 中图分类号 : S71846 ; Q9432 　　　文献标识码 : A 　　　文章编号 : 1001 - 7488 2008 10 - 0055 - 08 A FullLength cD NA Clone of Typical Y SK Dehydrin and Its Speculated 2 2 Physiological Role in the Seeds of Camellia oleifera Hu