龙眼mir159家族成员进化特性及时空表达-应用与环境生物学报.pdfVIP

2017-08-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2017.03011 / Chin J Appl Environ Biol 2017 23 ( 4 ) : 0602-0608 应用与环境生物学报 ， 龙眼miR159家族成员进化特性及时空表达* ** 陈旭 曾友竞 王嘉毅 陈晓慧 徐小萍 李汉生 张梓浩 陈裕坤 赖钟雄 王天池 林玉玲** 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州 350002 摘 要 为了解植物miR159家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达规律，以龙眼miR159家族为例对miRNA 家族进行探讨. 通过龙眼miR159家族前体与成熟体序列比对、前体二级结构预测、系统发育进化树的构建、靶基因 预测及实时荧光定量等手段，对龙眼miR159基因家族进行研究. 结果显示：龙眼 miR159家族存在7个前体成员和 6 个成熟体成员，序列比对发现 5个成熟体可以高度定位于7个前体序列中一个共有的、约 20个碱基的保守区域，推测 miR159成熟体主要来源于该区域；进一步分析发现6个成熟体序列中仅 2个可定位于pre-MIR159 中. mfold预测结果显 miR159 7 56.54 - 92.53 kal/mol 示 家族 个前体的最小折叠自由能在- - 之间，均能自发形成典型、稳定的茎环二级结构. 系 统发育进化树显示龙眼miR159家族前体与成熟体成员均具有保守性与多样性. 靶基因预测发现龙眼miR159家族所有 成员共预测出14个不同靶标，其中3个成员也可以作用于同一靶标. 实时荧光定量PCR显示，龙眼pre-MIR159家族成员 dlo-miR159 间在不同组织部位表达量差异显著，但表达趋势却几乎一致，其中花器官中表达量最高，提示了 在生殖器 官形成过程中具有重要的作用，尤其是在雄花中作用显著. 本研究表明龙眼miR159家族在进化过程中形成了保守性 与多样性并存的进化特性，并且可能在花器官形成过程中发挥了重要的作用. （图5 表3 参36） miR159 关键词 龙眼； 家族；进化特性；实时荧光定量 CLC S667.203 Evolutionary characteristics of miR159 gene family in Dimocarpus longan Lour., and their spatial and temporal expression* CHEN Xu, ZENG Youjing, WANG Jiayi, CHEN Xiaohui, XU Xiaoping, LI Hansheng, ZHANG Zihao, ** ** CHEN Yukun, LAI Zhongxiong, WANG Tianchi LIN Yuling Institute of