人体口腔微生物宏基因组的研究进展-华西口腔医学杂志.pdfVIP

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人体口腔微生物宏基因组的研究进展-华西口腔医学杂志

华西口腔医学杂志 第31 卷 第1 期 2013 年2 月 West China Journal of Stomatology Vol.31 No.1 Feb.2013 http:// ·107 · [文章编号] 1000-1182 (2013)01-0107-05 ·综述· 人体口腔微生物宏基因组的研究进展 邓盟 齐霞综述 徐欣 周学东审校 ( 口腔疾病研究国家重点实验室, 四川大学, 成都 610041 ) [摘要] 人体生态环境中共生着数量庞大的微生物群落,被誉为人体第二基因组。口腔微生物与口腔及全身的健 康和疾病有着密切的联系,新一代高通量基因芯片和第二代测序技术的涌现让人们对口腔微生物有了更全面的了 解。本文就微生物宏基因组研究技术、口腔微生物宏基因组及其与口腔和全身疾病防治的最新进展进行综述。 [关键词] 口腔微生物组;基因芯片;第二代测序;宏基因组 [中图分类号] R 780.2 [文献标志码] A [doi] 10.7518/hxkq.2013.01.027 Latest progress in unveiling the oral microbial metagenome Deng Meng, Qi Xia, Xu Xin, Zhou Xuedong. ( , , 610041, ) State Key Laboratory of Oral Diseases Sichuan University Chengdu China [Abstract] The human resident microorganisms constitute the second genome of human body. Oral microbiome is closely related to the oral and systemic health and diseases. Implementation of high-throughput gene chip and second- generation sequencing has gained in-depth characterization of the oral microbiome, changing our view on host-microbe interactions. In this review, we summarized the latest progress in oral microbial metagenomics and addressed its poten- tial value in the prevention and treatment of oral diseases and other systemic disorders. [Key words] oral microbiome ; gene chip ; second-generation sequencing ; metagenomics 人体生态环境中共生着数量庞大的微生物群落, 户,由于口腔特殊的解剖结构及生理特点,口腔中 包括数千种微生物,10~100万亿个微生物细胞,是 定植着复杂的微生物群落。 口腔内环境稳态易受外 人体躯体和生殖细胞总和的10倍;并含有2千万个独 界因素的干扰,口腔内部有多位点、多层次的微生 特的微生物基因,基因数量超过人体基因数量100 物定植生态区,口腔环境的异质性较肠道更为明显。 倍。此外,微生物提供了人类进化所不具有的特殊 近几十年厌氧培养、分子生物学技术、高通量基因 代谢特性,微生物组的变异潜能远大于人体组织。 芯片和第二代测序技术的应用,让人们对口腔微生 因

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