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基因组重排和人类基因组病-中国循证儿科杂志
·150· ChinJEvidBasedPediatr April2014,Vol9,No2
·综述·
DOI:10.3969/j.issn.16735501.2014.02.012
基因组重排和人类基因组病
1 2 2 1 2
王慧君 LiuPengfei BiWeimin 周文浩 CheungSauW
基因组病(Genomicdisorders)的概念最早由Lupski在 制可解释双链 DNA断裂片段和末端修复[10,11]。与NAHR
1998年提出,是指由于人类基因组 DNA的异常重组而引 不同,NHEJ不需要LCRs参与。其中,NAHR和DNA复制
[1]
起临床表型的一类疾病 。其分子基础是DNA的异常重 机制可解释了大量的生殖系细胞和体细胞的DNA重组事
组导致基因的缺失/扩增,或基因结构的彻底破坏,基因组 件。常见基因组重排机制举例见表1。
-1 -5 -8
重排处的突变发生率(10 ~10 )可高达点突变(10 )
的1000倍以上[2~4]。随着检测技术的逐渐改进和检测成 1 NAHR的发生机制与基因组病
本的降低,采用高分辨率的染色体微阵列分析芯片(CMA) 尽管NAHR与基因组异常这种现象在 10年前就已提
[7]
可在 临床病例 中发现更多 的基 因组拷 贝数变异 出 ,但其重组的原因并不清楚。通过研究 17p11.2的缺
[5,6] 失和扩增,发现NAHR发生的频率与重复序列长度密切相
(CNV) 。利用迅速发展的新一代测序技术 (next
[12]
generationsequencing,NGS)可进行断裂点(breakpoint)的序 关,并受重复片段之间距离的影响 。LCRs之间的距离
列分析,解释DNA重组的机制。最近,陆续发现的人类基 (kb)远比发生同源重组的序列(bp)长。另外,同源重组发
因组病为从机制上解释各种基因重组提供了研究素材。本 生的位点有一定的序列特异性,特殊的DNA序列可成为同
文就近几年新的研究进展进行综述,通过剖析临床病例,解 源重组的热点区域。重组热点区域富含GC碱基,如 13个
释CNVs发生的机制,为临床医生展现基因组病研究领域 碱基(5′CCNCCNTNNCCNC3′)的基序(motif)负责40%热
的新成果和有价值的病例研究信息。 点区域的重组[9,13]。虽然此热点基序是在AHR中证实,但
[14,15]
等位 同源重组 (allelichomologousrecombination, 也见于 NAHR 。这说明NAHR和 AHR共享重组热
AHR)是指减数分裂中基因组同一位点的DNA序列与其同 点[16~18]。此后证实,该基序是一种锌指结合蛋白PRDM9,
源序列进行重组,AHR是生物多样性的来源。而对于基因 组蛋白H3三甲基转移酶的结合位点[19,20]。PRDM9基因
组上的重复序列,除同一位点上的同源序列外,不同位点 变异可强烈影响减数分裂同源重组热点区域的活性、微卫
上的重复序列也高度同源,可发生非等位同源重组
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