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三种瓜类作物ssr扩增的通用性与多态性分析
华北农学报 ·2 0 0 8 , 2 3 ( 4 ) : 1 10 1 14
三种瓜类作物 SSR 扩增的通用性与多态性分析
1 ,2 2 1 2 2 2 2
李 楠 ,张海英 ,陈年来 ,王永健 ,许 勇 ,宫国义 ,郭绍贵
( 1. 甘肃农业大学 农学院 ,甘肃 兰州 730070 ;2 . 北京市农林科学院 蔬菜研究中心 ,北京 100097)
摘要 :利用 940 对 SSR 引物 ,对甜瓜 、黄瓜和西瓜三套重组 自交系群体的作图亲本 DNA 进行 PCR 扩增 ,分析 SSR
引物在不同瓜类作物间的通用性与多态性 。结果表明 ,上述 SSR 引物在甜瓜 、黄瓜和西瓜等不同瓜类作物间具有一
定的通用性 ,最小通用率超过 24 % ,说明不同瓜类作物基因组间存在一定的相似性 。但瓜类 SSR 引物的种属特异性
很强 ,能够检测的多态率很低 ,三套作图亲本之间能够共用的多态性 SSR 引物比例甚至不足 1 % 。
关键词 :瓜类作物 ;SSR ;通用性 ;多态性
( )
中图分类号 :Q753 文献标识码 :A 文章编号 :1000 - 7091 2008 04 - 0110 - 04
Comparison of Versatility and Polymorphism of SSRs in Three Cucurbitaceae
1 ,2 2 1 2
L I Nan ,ZHAN G Haiying ,CHEN Nianlai ,WAN G Yongj ian ,
XU Yong2 , GON G Guoyi2 , GUO Shaogui2
( 1. Agronomy College , Gansu Agricultural University ,Lanzhou 730070 ,China ;
2 . Beij ing Vegetable Research Center ,Beij ing 100097 ,China)
Abstract :In this study ,by PCR amplification with the genomic DNA of three mapping parents ,940 SSRs primers
were tested for analysis their versatility and polymorphism in melon ,cucumber and watermelon . The results indicated that
these SSR primers had some versatility in the above crop sThe minimum SSR transferability was higher than 24 % ,show
ing some similarity in the genome of these crop sBut these SSR primers also had strongly genus specialty ,their polymor
phism level was very low ,the ratio of common polymorphism SSR primers among these crop s was lower than 1 %
Key words :Cucurbitaceae ;SSR ;Transferability ;
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