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中国人群细胞黏附相关基因多态性与非综合征型唇腭裂的关联研究
北 京 大 学 学 报 ( 医 学 版 )
JOURNALOFPEKINGUNIVERSITY(HEALTHSCIENCES) Vol.48 No.3 Jun.2016 ·403·
·论著 ·
中国人群细胞黏附相关基因多态性与非综合征型
唇腭裂的关联研究
1 2 3 4,5 6 7 8 1 1 9
袁 园 ,王 苹 ,吴雅慧 ,叶晓茜 ,黄尚志 ,石 冰 ,王 科 ,王竹青 ,刘冬静 ,王子凡 ,
1△ 1
吴 涛 ,王 红
(1.北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,北京 100191;2.北京市疾病预防控制中心信息统计中心,北京
100013;3.林口长庚纪念医院医学研究部,中国台湾桃园市33305;4.武汉大学口腔医院儿童口腔科,武汉430079;
5.MountSinaiMedicalCenter,NewYork10029,USA;6.中国医学科学院,北京协和医学院基础学院医学遗传学
系,北京 100005;7.四川大学华西口腔医学院口腔颌面外科,口腔疾病研究国家重点实验室,成都 610041;8.青岛
大学医学院口腔外科,山东青岛266000;9.北京大学基础医学院,北京 100191)
[摘 要]目的:探索中国人群中细胞黏附相关基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(isolatednon
syndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL/P)的关联关系及可能存在的基因环境交互作用。方法:对一项
国际多中心的全基因组关联研究(genomewideassociationstudy,GWAS)的数据进行再分析,选取其中806个中国
人群NSCL/P核心家庭,对该人群的8个细胞黏附相关基因包括 CDH1、CTNNB1、PVRL1、PVRL2、PVRL3、ACTN1、
VCL、LEF1进行了传递不平衡检验(transmisssiondiseqilibriumtest,TDT)及基因环境交互作用分析。环境因素包
括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、饮酒及服用多种维生素。结果:经数据质量控制后,共纳入226个单核苷酸多态
性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位点,TDT结果显示,CTNNB1、CDH1、ACTN1基因中有 23个 SNPs与
NSCL/P之间存在关联(P<0.05),但经Bonferroni校正后,这些关联均无统计学意义(P>0.0002)。基因环境交
互作用的分析结果显示,14号染色体的ACTN1基因中rs743127位点与母亲孕期被动吸烟的交互作用具有统计学
意义(P=0.0001),母亲孕期无被动吸烟时携带一个该危险位点的患儿的OR值为0.59(95%CI:0.38-0.90),患
儿母亲孕期中有被动吸烟情况时携带一个危险位点的患儿的OR值为2.00(95%CI:1.23-3.26)。而ACTN1基因
的rs1475034、rs370535、rs2273419位点、CTNNB1基因的rs106871位点与被动吸烟和PVRL3基因的rs7634000、
rs2971366、rs2634553、rs1489032、rs7624812位点与母亲孕期补充维生素的交互作用并无统计学意义(P>0.0002)。
结论:传递不平衡检验未发现所纳入的细胞黏附相关基因多态性与NSCL/P存在关联,但基因环境交互作用分析
结果提示,ACTN1基因可能通过基因环境交互作用而影响NSCL/P的发病风险。
[关键词]ACTN1;唇裂;多态现象,遗传;基因相关性研究;基因环境交互作用
[中图分类号]R181.33 [文献标志码]A [文章编号]1671167X(2016)03040306
doi:10.3969/j.issn.1671167X.2016.03.005
Associationstudybetweencandidategenesinvolvedincellcelladhesionandnon
syndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalateinChinesepopulation
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