MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析.pdfVIP

第 43卷第 11期 温 州 医 学 院 学 报 VOl_43No．11 2013年 11月 JournalofWenzhouM edicalCollege Noq．2013 期 MAGE—A家族抗原共同B细胞表位预测分析 金劲激 ，丁玉杰 ，王冰冰 。，侯柏龙 ，张丽芳 。 ， 朱冠保 (1．温州医科大学附属第一医院 胃肠外科，浙江 温州 325000；2．温州医科大学 分子病毒与免疫 研究所，浙江 温州 325035) [摘 要]目的 ：预测和筛选黑色素瘤抗原A(MAGE—A)家族抗原的共同B细胞表位。方法：以MAGE—A1的 全长氨基酸序列为基础，利用生物信息学软件，采用HoppWoods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和 Jameson—Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等，结合MAGE—A1的二级结构与其柔性区域及跨膜区 域对MAGE—A1的优势B表位 区段进行综合分析，进一步运用抗原指数分析预测MAGE—A1的B细胞表位，并将 其与MAGE—A家族中其他成员 (MAGE—A2至AI2)进行比对，以预测MAGE—A家族抗原的共同B细胞表位。结 果：MAGE—A1的全长为309个氨基酸，相对分子质量为46kDa，为可溶性蛋 白。经综合分析，其B细胞优 势表位可能存在于氨基酸序列N端的9～14，84～88，118—124，160～165，208～214，233～240区段； 经与MAGE—A家族中其他成员的氨基酸序列比对，MAGE—A1的9～14，84—88，118～124及233～240区段， 即HCKPEE，EEEGP，RAREPVTK，GEPRKLLT肽段可能为MAGE—A家族抗原共同B细胞优势表位。结论：利用生 物信息学预测发现MAGE—A1的优势B细胞表位中，9～14，84～88，118～124及233～240区段可能为MAGEA 家族抗原的共 同B细胞表位，可为表位疫苗的研制等提供理论依据 。 [关键词] 黑色素瘤抗原A家族；黑色素瘤抗原Al；B细胞表位；共同表位 [中图分类号] R730．2 [文献标志码] A [文章编号] 1000—2138(2013)¨一0706—05 ComprehensivemappingofcommonimmunodominantB-cellepitopesofMAGE-Asubfamily JlNJ il． DING Yujie，WANG Bingbing。，HOUBolong。，ZHANGLifang。，ZHUGuanbao． ．Departmentof GastroenterologicalSurgery,theFirstAffiliatedHospitalofWenzhouMedicalUniversity,Wenzhou，325000 2．InstituteofMolecularVirologyandImmunology,WenzhouMedicalUniversity，Wenzhou，325035 墨圆圈 Objeetive：TopredictandscreenthecolnlilOnB—cellepitopesofhtemelanomaantigenA(MAGE— A)subfamily．M ethods：Baseonthefull—lengthaminoacidsequenceoftheMAGE—A1．theB—cellepitopesofthe MAGE—Alproteinwaspredictedbybioinformaticssoftware．includingthehydrophilicplottechnique．polarity parameters，surfaceprobability，antigenicindex，andthesecondarystructure，alongwithitsflexibleregionsand transmembraneregionanalysis，thena