番茄粉红色果实相关基因的dCAPS 和InDel 标记开发与应用.pdfVIP

研究论文 中 国 蔬 菜 CHINA VEGETABLES 2016（1）：24-29 番茄粉红色果实相关基因的 dCAPS 和 InDel 标记开发与应用 董淑芳　王孝宣　高建昌　国艳梅　黄泽军　杜永臣 * （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081） 摘　要 ：采用SuperBSA方法分别构建100份粉红色番茄材料和100份红色番茄材料的DNA混合池，对测序结果的SNP位 点进行分析。结果表明：在1号染色体上的127个SNP位点中，有6个与番茄果实颜色高度相关，其中1个位点与粉红色 果实高度相关。利用该SNP位点开发了1个共显性dCAPS标记，在红色、粉红色和杂合F13种基因型之间的多态性较好。 同时，利用番茄重测序数据分析番茄起源时发现，在粉红色番茄中SIMYB12 基因的上游存在1个603bp的缺失，利用该缺 失突变位点开发了1个共显性InDel标记，在红色、粉红色和杂合F13种基因型之间也表现出较好的多态性。利用新开发的 2个标记对F2 群体进行遗传分析，鉴定结果与田间表型观察结果符合度均达到95%以上，表明这2个标记可以用于番茄苗 期分子标记辅助选择。 关键词 ：番茄；粉红色果实；dCAPS；InDel；分子标记 番茄（Lycopersicon esculentumMill.）是世界人 升。因此，高品质粉红色番茄品种的选育已是我国 民喜爱的重要蔬菜作物。据联合国粮食及农业组织 重要的育种目标之一。但由于中国非番茄原产地， （FAO）统计，2013年全球番茄年产量为163963 番茄种质均直接或间接引自国外，而且多数为红色 万t。番茄在我国栽培历史虽短，但已经成为主 果实，不太符合中国、日本、韩国等亚洲人的消费 要的蔬菜作物之一，年种植面积已达125.5万hm2 习惯，所以在育种中常需要将红色番茄材料转育为 （1882.5万亩），年产量3010.2万t（董春娟等， y 粉红色。番茄粉红色果实由隐性基因 控制，采用 2015）。番茄品种多、用途广、营养丰富，番茄红 常规的育种方法需要在F2才能通过表型进行选择。 素有很强的抗氧化功能，具有较高的营养价值和保 因此，开发与番茄粉红色果实性状紧密连锁的分子 健作用。随着人民生活水平的提高，消费者对番茄 标记，可极大地提高苗期选择的效率。 大小、形状、颜色、风味、耐贮运性等不断提出更 Adato等（2009）克隆了与番茄透明果皮相关 高的要求，生产上迫切需要品质好、抗性强、产量 的基因SIMYB12 ，但是根据其公布的分子标记对育 高的番茄品种（裴华丽等，2014）。 种材料进行鉴定的结果与国内多数粉红色番茄材料 粉红色番茄受到中国、日本、韩国等亚洲人的 不符合。因此，中国农业科学院蔬菜花卉研究所鲜 喜爱。在中国北方地区粉红色番茄的需求量很大， 食番茄课题组于2013年将100份高代粉红色番茄 近年来南方地区对粉红色番茄的需求量也在逐渐提 材料和100份红色番茄材料进行了混合建池，拟采 用SuperBSA（bulkedsegregationanalysis）方法开发   董淑芳，女，硕士研究生，专业方向：蔬菜遗传育种，E-mail： 与番茄粉红色果实紧密连锁的分子标记。 shufangdong04@163.com 最近，本所鲜食番茄课题组在利用番茄重 *通讯作者（Correspondingauthor）：杜永臣，研究员，博士生导师，专 测序数据分析番茄起源时发现，在粉红色番茄中 业方向：蔬菜遗传育种，E-mail：duyongchen@ SIMYB12