南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析.pdfVIP

园艺学报，2016 ，43 (2) ：373 –383. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0418；http ：//www. ahs. ac. cn 373 南方红豆杉 4 个微卫星位点等位基因变异分析 1,2 3,* 1 4 1 1 谢伟东 ，文亚峰 ，韩文军 ，周 宏 ，徐刚标 ，陈建华 1 2 3 （中南林业科技大学林学院，长沙 410004 ； 广西大学林学院，南宁 530004 ； 中南林业科技大学风景园林学院， 4 长沙 410004 ； 广东省韶关市林业局，广东韶关 512000 ） 摘 要：以南方红豆杉（Taxus chinensis var. mairei ）的4 个微卫星位点为例，通过等位基因长度和序 列变异分析，对各位点等位基因的变异特点、变异来源和进化关系进行研究。结果表明：这 4 个位点在 南方红豆杉种内表现出丰富而复杂的变异特点，既有 SSR 重复区突变形成的等位基因，也有因侧翼序列 插入/缺失（Indel ）形成的等位基因，还存在同一长度形态的同形异源等位基因（allelic homoplasy ），同时， 在 1 个 mtSSR 位点中检测到了线粒体基因的异质性（heteroplasmy ）。SSR 重复序列和侧翼序列突变的共 同作用是引起等位基因长度异常的主要原因。等位基因分布及其进化关系研究表明，4 个位点的序列突变 更符合逐步突变模型（SMM ），常见等位基因在进化上具有原始性。 关键词：南方红豆杉；微卫星标记；等位基因；序列变异；基因突变 中图分类号：S 68 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2016 ）02-0373-11 Variation Analysis of Four Microsatellite Loci Within Maire Yew Species 1,2 3,* 1 4 1 1 XIE Wei-dong ，WEN Ya-feng ，HAN Wen-jun ，ZHOU Hong ，XU Gang-biao ，and CHEN Jian-hua 1 2 （College of Forestry，Central South University of Forestry and Technology，Changsha 410004 ，China； College of 3 Forestry ，Guangxi University，Nanning 530004，China； College of Landscape Architecture，Central South University of 4 Forestry and Technology ，Changsha 410004 ，China； Forestry Bureau of Shaoguan ，G