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Blast本地化安装图解
Blast本地化:window平台下blast软件的安装
boyun发表于 2009-07-09 17:08 | 阅读 1 views
1.对于windows 2000/xp 用户,下载blast-2.2.18-ia32-win32.exe安装文件/blast/executables/LATEST/blast-2.2.18-ia32-win32.exe
2.创建一个新目录,例如C:\blast,将下载的文件blast-2.2.18-ia32-win32.exe复制到该目录,双击这个文件,自解压产生bin、data、doc三个目录,bin是程序目录,data是程序使用数据的目录,doc是文档目录。
表:bin目录中的程序
程序 说明 bl2seq.exe 进行两条序列比对 blastall.exe 做普通的blast比对 blastclust.exe ? blastpgp.exe ? copymat.exe ? fastacmd.exe 通过gi号,接收号等,在数据库中检索序列 formatdb.exe 格式化数据库 formatrpsdb.exe ? impala.exe ? makemat.exe ? megablast.exe megablast程序 rpsblast.exe ? seedtop.exe ? 3.用文本编辑器创建一个ncbi.ini文件,文件包含下面内容:
[NCBI]
Data=C:\blast\data\
将ncbi.ini文件存放到系统的Windows 或者 WINNT目录。
4.将”C:\blast\bin”目录添加路径中(该步骤非必须,但会给以后的操作带来方便),方法:1)右击我的电脑选择属性,选择高级,点击环境变量,
设置环境变量
2)系统变量中,选择Path,点击“编辑”,在变量值的后面添加“; C:\blast\bin”,点击确定
将安装路径添加到path
5.测试,打开dos窗口(点击开始,选择运行,打开的输入框中输入“cmd”,确定),键入“blastall”,回车,如果安装正确,将显示blastall的所有参数说明。
安装测试
注意:
如果报错:“‘blastall’不是内部或外部命令,也不是可运行的程序或批处理文件。”,请检查环境变量设置,或者切换到安装目录的bin目录下,再执行。
如果报错:“FATAL ERROR: FindPath failed.”,请检查ncbi.ini文件
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