多位点单倍体型分数检验-EmpowerStats.PDFVIP

多位点单倍体型分数检验 采用计算分数（score)的方法，检测多位点单倍体型与表型的相关性，筛 选出最可能导致疾病发生的单倍体型。表型特征可以是两分类型（有与无）、 有序多分类型、正态分布的定量型和符号泊松分布的类型。检验包括对几个位 点单倍体 型的全局检验与特异单倍型的分数试验，并允许调整其它协变量。效 应包括相加性、显性或隐性模型。此外该模块还可有一个选项来让计算机随机 组合数据，计算模拟的p 值，这对于小样本量或偏离假定分布的数据尤为重 要。 关于分数检验详见：Schaid DJ, Rowland CM, Tines DE, Jacobson RM, Poland GA. Score tests for association between traits and haplotypes when linkage phase is ambiguous. Am J Hum Genet 2002;70:425-34。 例 1，某研究选取血管紧张素原（angiotensinogen, AGT）基因启动子- 217，-152，-20，-6， 内含子1 的+31，共5 个位点，对100 例正常人进行了 SNP 位点基因型检测，点击这里下载数据，其中0,1,2 分别代 表5 个位点的