基因组序列信息分析 吕合作.pptVIP

基因组序列信息分析 吕合作 教学目的要求 掌握：一些与基因组序列分析有关的基本概念 1.HGP 2.基因组 3.基因组学 4.结构基因组学 5.功能基因组学 熟悉：HGP的主要任务及内容 功能基因组学的主要研究内容及策略 了解：与基因组序列分析有关的一些大型公用数据库 基因组学的研究内容 结构基因组学 功能基因组学 (后基因组学) 蛋白质组学 STS 含 量 图 ? 所用的STS标记物是通过PCR测定的； STS与一个大的插入克隆基因库反应，如YAC/BAC/粘粒 ? 分辨率和STS覆盖度决定因子： STS密度、克隆群体大小及克隆文库深度 ? 制图简单使用较多的STS含量图： 巴黎的CEPH(Center; Etudes du Ploymorphisme Humain)中的YAC库[10×覆盖率,插入片段约1Mb] ? NCBI Entrez 的染色体图谱 /Database/index.html 人类基因组、鼠类、果蝇、线虫及一些原生动物图谱 例：人类Y 染色体物理图谱 ? GDB（The Genome Database）的浏览染色体图谱 美国约翰.霍普金斯大学基因组数据库 / 国内镜像：北京大学 / 点击“Other_Search_Option”? 例：人类Y 染色体物理图谱