RNA剪切.ppt

第七章 转录产物的加工修饰及转运降解 1 引言--几个重要概念 2 tRNA和rRNA的加工 3 真核生物mRNA的加工、修饰 4 RNA的转运及降解 5 小 结 1 引言-几个重要概念 基因（gene): 指能编码独立产物的特有DNA序列。 顺反子(cistron): 指编码一种蛋白质的DNA单位组成。 断裂基因(interrupted gene): 对可表达为蛋白质的基因，如其初始转录产物与成熟mRNA相比，其间含不能编码为蛋白质的间隔序列，则这个基因称断裂基因。 interrupted gene 含： 内含子(intron) ：断裂基因中，转录但通过将两端的序列（外显子）剪接在一起而被去除的转录产物所对应的DNA片段。 外显子(exon): 断裂基因中，在成熟mRNA产物中存在的任何片段。 hnRNA (heterogeneous nuclear RNA)：不均一核RNA 高等真核生物中，如细胞核基因与其产物间在长度上有差异，则其初始转录产物称为hnRNA。 hnRNP:核糖核蛋白颗粒 hnRNA物理结构是核糖核蛋白颗粒，颗粒中蛋白质包围着hnRNA，hnRNA和蛋白质组成的复合物称hnRNP。 sRNA (100-300 base, 0-106/cell): 1）snRNA: 细胞核中的小分子RNA称细胞核小RNA (small nuclear RNA) 2）scRNA: 细胞质中小分子RNA称细胞质小RNA (small cytoplasmic RNA)。 3）snoRNA: 在核仁中存在的一类小的RNA，称为核仁小RNA (small nucleolar RNA)。 2 tRNA和rRNA的加工 tRNA和rRNA被加工的实验证据 2.1 前体tRNA的加工 2.2 前体rRNA的加工 2.3 RNA的编辑及化学修饰 tRNA和rRNA被加工的实验证据 rRNA和tRNA有以下三点特性： 1） 所有RNA初级转录产物5`末端均是5`-三磷酸，而成熟rRNA和tRNA分子5`末端是5`单磷酸； 2）rRNA和tRNA分子比初级转录产物小很多； 3）所有tRNA含有稀有碱基。 2.1 前体tRNA的加工 ① 3`-OH末端的形成：内切核酸酶降解，RNase D 逐个去除多余核苷酸，核苷酸转移酶催化3′末端加CCA-OH（如需要的话）； ② 5`-P末端的形成：核酸内切酶RNase P作用下，从5′末端切除多余的核苷酸； ③内含子剪接：核酸内切酶催化剪切反应，剪掉内含子，由连接酶连接外显子。 ④化学修饰：如甲基化、脱氨基、还原反应。 All of the four bases in tRNA can be modified 真核生物中rRNA前体包括了18 S rRNA、5.8 S rRNA和28 S rRNA序列。在高等真核生物中，命名为45SRNA，低等真核生物中较小（如酵母中为35S） 原核生物中前体包括了16S rRNA、23S rRNA和5S rRNA和tRNA序列。前体为30S RNA。 2.3 RNA的编辑及化学修饰 RNA的编辑(RNA editing): 某些RNA，特别是mRNA的一种加工方式，它导致了DNA所编码的遗传信息的改变（如单碱基突变）（P95、96）。 RNA的修饰（RNA modification）： 有些RNA，特别是前体rRNA和tRNA可能有特异性的化学修饰（P98）。 3.3 前体mRNA内含子的删除 3.3.1 生物体内内含子的种类 3.3.2 内含子的删除机理 3.3.3 内含子的不同剪接方式 3.3.1 生物体内内含子的种类 5` splice site含：GU 3` splice site含：AG GU-AG（最初称GT-AG） 规则：描述了在前体mRNA中内含子的最初及最末位置上必须出现的恒定的双碱基 核内RNA完成剪接所需的只是5`位点、3`位点和分支位点（branch site) UACUAAC 的三个短的一致性序列。 分支位点位于内含子3`剪接位点18~40个核苷酸处。 snRNA是GU-AG型内含子剪接所必需的 参与剪接过程的5个snRNP是U1，U2，U4，U5和U6。 每个snRNP含一个snRNA 和几种蛋白质。 snRNP和其他一些辅助蛋白共同构成剪接体。 （2）GC-AG型和AU-AC型内含子 人类基因组剪接位点： GU-AG＞98% GC-AG＜ 1% AU-AC≈0.1% 注意：