山羊褪黑激素受的体1a基因hinfⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析_本科.docVIP

本科毕业论文 题 目： 山羊褪黑激素受体1A基因HinfⅠ酶切 多态性及其与产羔数性状的关联分析 姓 名： 学 号 专 业： 动 物 科 学 指导教师： 职 称 分类号 密级 华中农业大学本科毕业论文 山羊褪黑激素受体1A基因HinfⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析 HinfⅠ-RFLP of Melatonin receptor 1 A(MTNR1A) gene and the association with the litter size traits in goat 目 录 摘 要 4 Abstract 5 前 言 6 1.材料与方法 7 1.1 材料 7 1.1.1 试验动物 7 1.1.2 实验材料 7 1.1.3主要试剂的来源 7 1.1.4主要仪器设备 8 1.1.5主要试剂的配置 8 1.1.6主要分子生物学软件 10 1.2 方法 10 1.2.1.山羊基因组DNA的提取 10 1.2.2.引物设计及其序列 10 1.2.3.PCR扩增及其电泳检测 11 1.2.4. 限制性内切酶消化扩增产物以及电泳检测 13 1.2.5.统计分析 14 2 结果与分析 15 2.1 PCR扩增结果 15 2.2酶切结果 15 2.3 褪黑激素基因频率和基因型频率分析结果 16 2.4 MTNR1A基因型与波尔山羊头胎产羔数性状的关联分析 17 2.5 MTNR1A基因型与经产产羔数性状的关联分析 17 3 讨论 18 3．1 不同山羊品种基因型频率及基因频率差异 18 3．2 MTNR1A不同基因型对波尔山羊头胎和经产羔数的影响 18 参考文献 19 致 谢 20 山羊褪黑激素受体1A基因HinfⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析 摘 要 本研究以褪黑激素受体1A 基因为候选基因，分析该基因多态性对山羊产羔数性状的影响。采用限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length polymorphism， PCR-RFLP）方法，检测了65只波尔山羊和51马头山羊褪黑激素受体1A基因HinfⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析。结果表明，褪黑激素受体1A基因在波尔山羊中存在HinfⅠ酶切多态性，而在马头山羊样本中则无多态性。在波尔山羊中，检测到AA、GG两种基因型，未检测到AG型；其中AA基因型个体在出现频率最高，为0.554，GG型为0.446；A、G等位基因频率分别为0.554和0.446。性状关联分析结果表明：波尔山羊的AA基因纯合型头胎平均产羔数比GG基因杂合型多0.07只，加性效应值为0.035，显性效应值为-1.42；经产羔数的AA型比GG型多0.09只；加性效应值为0.046，显性效应值为-1.84。A等位基因可能与波尔山羊产羔数呈正相关，该位点主要以加性方式起作用。 关键词：山羊；繁殖性状；褪黑激素受体；PCR—RFLP HinfⅠ-RFLP of Melatonin receptor 1 A（MTNR1A） gene and the association with the litter size traits in goat Abstract In the present study， Melatonin receptor 1 A gene （MTNR1A） was analysed to find the assocation with litter size in goat as a candidate gene. HinfⅠ-RFLP （Restriction Fragment Length polymorphism， RFLP） of MTNR1A was found in 65 Boer goats and 51 goats Ma Tou. No polymorphism was detected in Ma Tau goats . Two genotypes AA， GG were found in Boer goats. The frequency of AA genotype was higher than GG genotype， which were 0.554 and 0.446， respectively. The allele frequencies for A and G were 0.554 and 0.446. The results of traits association analysis showed that individuals with AA genoty