Nodal基因的剪接异构体分析.pdf

第 29卷第 8期 内江师范学院学报 No．8Vo1．29 J0URNALOFNEIJIANGNORMALUNIVERSITY ·41 · Nodal基因的剪接异构体分析 曾凡才 ， 赵太强 ， 莫冬阳 ， 余文静 (1．泸州医学院 生物化学与分子生物学实验室， 四川泸州 646000； 2．四川省人 民医院 检验科， 四川 成都 610072) 摘 要：利用GenBank数据库中Noda1分子的核酸和蛋 白相关信息，采用生物信息学方法分析Nodal的分子 生物学特征及其剪接异构体．应用基因克隆方法克隆人Nodal基因．结果表明Nodal基因至少有四种剪接异构体， 除研究较清楚的isoform 1相对完整外，其它剪接异构体信息并不完整、功能未知且表达可能有组织特异性．特别 是虽然Nodal基因isoform1的氨基酸编码序列已知，但是发现 目前NCBI提供的Nodal基因mRNA参考序列并 不完整．通过基因克隆发现一种新 的Nodal基 因剪接异构体 ，它可能具有 TGF-／3超家族 的特征性结构，但功能未 知．结果说明人Nodal基因可能至少存在 5种剪接异构体，除 isoform 1外，其它 isoform具体功能还有待进一步研 究． 关键词：Nodal；剪接异构体；生物信息学；表达序列标签 DOI：10．13603／j．cnki．51—1621／z．2014．08．012 中图分类号：Q71 文献标志码 ：A 文章编号：1671—1785(2014)08—0041—07 0 引言 Nodal基 因在 GenBank中的表达序列标签 (ex— pressedsequencetags，EST)序列 ，讨论可能存在的 TGF—(transforminggrowthfactor—)超家族 Nodal基因剪接异构体，并且在克隆人的Nodal基 成员众多，功能多样化，在胚胎发育、左右不对称模 因时发现了一种新 的Nodal基 因剪接异构体 ，为进 式的形成 、免疫调节 、肿瘤的发生和转移等多方面发 挥了重要的作用[1]．Nodal(nodalgrowthdifferen— 一 步研究Noda1分子的功能和促肿瘤作用机制提供 tiationfactor)作为TGF—B超家族成员之一 ，最初研 参考和指导作用． 究发现它是胚胎发育中一个重要的形态发生素分 1 材料和方法 子 ，主要功能是维持胚胎干细胞不分化、诱导中内胚 层和指导内脏器官左右不对称的形成 [3]．而最近研 1．1 材料 究表 明Noda1分子在多种恶性肿瘤 ，特别是在高浸 1．1．1 细胞株及培养条件 润性和高转移性肿瘤组织和细胞株 中高表达，与肿 MDA—MB一231细胞购 自中国科学院上海细 瘤的发生、发展、浸润和转移等密切相关，它可能作 胞库．MDA—MB一231用含 1O 胎牛血清的高糖 为肿瘤诊断的标志分子和生物治疗靶点L4]．现有研 DMEM培养基培养．细胞培养条件为 37℃，5 究虽然发现Nodal在肿瘤 的发生和发展 中有重要作 CO 和 100 湿度，细胞传代和保存参 照中国科学 用 ，但详细 的分子机制并未清楚 ，特别是不清楚 院上海细胞库推荐条件进行． Nodal基因的剪接异构体 (splicingisoform)种类和 1．1．2 试剂 功能如何?本文主要通过生物信息学方法分析 TaqDNA聚合酶、核酸分子量标准购 白天根生 收稿 日期 ：2014-04—08 基金项