基于Mimox工具分析幽门螺杆菌Catalase模拟表位.pdfVIP

·299· ·论著· 基于Mimox工具分析幽门螺杆菌Catalase模拟表位 李妍曾爽宁云山 【摘要】 目的利用Mimox软件分析幽门螺杆菌Catalage蛋白模拟表位的性质，并与手工比对结 果进行比较。方法将源于噬菌体随机肽库筛选技术获得的5个Catalage模拟表位输入Mimox网站， 参数设定为默认值，进行模拟表位的比对，寻找共同序列并分析其性质。结果从ClnstalW界面兜对结 S 果看，氨基酸P…T L、A出现频率较高，通过统计学的方法推导出的共同序列为-[HST]X[DST]FRPXA [1wQ][LV][阿]T-，其中氨基酸P(80％)和A(60％)的出现频率较高。通过JalView界面推导出的共 同序列为．H．DFRP—AT—T-，保守性上氨基酸T(分值8)、P(分值6)、D(分值5)比较高；特性上氨基酸T (80％)、A(60％)、T(60％)比较高，与先前手工比对得出的结论基本相符。结论结合噬菌体筛选技 术和生物信息学Mimox工具对模拟表位进行分析，可以获得较全面的表位信息。 【关键词】Mimox软件；模拟表位；幽门螺杆菌；Catslase ofhelicobacter OnmimoxtoolLI ataI跚based Mimotopeanalysis pylori Yah，ZENGShuang，NING Yun-shan．1ast／tute Medleal o，Biotherapy，SchoolofBiotechnotogy，Southern 510515， University，Guangz幻u China author：NING Corresponding Yun—shan：E-mail：nys@fimmu．com To thecharacteristicsof fromHelicobacterCatalasea- 【Abstract】Objectiveanalyze mimotopes pylori Mimoxsoftwareand with Five derivedfrom dis— sing comparemanuallyalignment．Me血odsmimotepes phage were Mimox withall playlibraryinput web(http：／／immanet．cn／minmx／)andaligned parameters柏defaults． setof and ResultsTheinterfaceClnstalWthe the ofaminoacids aligned mimotopesappearancefrequency P， was statisticalmethoddedueedthecoI№∞m T，S，L，A higher．The seqtlence《HST]x[DST]FRPXA whichthe ofaminoacids [TNQ][Lv][冈]T·，inappearancefrequencyP(80％)andA(60％)w∞high- of er，Theinterface deducedthe