基于信息变化量衡量主成份分析在基因芯片聚类中的作用研究.pdf

基于信息变化量衡量主成份分析在基因芯片聚类中的作用 马宁张正国 (中豳医学科学院，北寐协和医学院，基础医学研究所，^：：I￡柬100005) 摘翼；蒸因芯片的数据待蔷旰方法巾，聚类一氟戆最常绡乎段之一。许多研究赣认为主成份分析可以籽效的挖掘数 据中游在的结鞫并抑制噪声。如果聚麓分柝建悫柱一个清晰的数报结构上，将携离结鬃准确率。慨由予基因芯片 毂撅尽有一定特球性，熬翻问稃在栩甄作用而被此井举独成。艇以主成衙分析作为聚炎的蒲捉魑胥仍然成血，线 为一个缀褥撵讨的阀趱。我们刹用曼组猩嫩物学镦人为分类的麓鳓毽片悸为评翔标准．通过一个麓予倍息蹙他的 最来褥惫，在聚樊之辩徽燕成份提取憝荫肖助予提商分类的准确率。揣息登化擞羧其它谬判聚樊桐似性孵方法舆 有～定优势．蜡累袭嘲猩多数没霄蚌部分搂标准的熬网芯片宓验巾，聚摊前徽赢成份分辑不会带来缩果l!I孽轻蒋提 升，裁獬可能酶低凝燮准确攀。 荚键窜：啦物信息擘：熬因芯持{燕成份舒柝：信崽变化 theEffectsofPCAin Data Based Assessing MicroarrayClustering onVariationofInformation MA ZHANG Ning Zhengguo (Instituteof Medical ofMedicaI UnionMedical Basic Sciences，ChineseAcademy Sciences,Peking 100005) College,Beijing data has beenthemost Abstract：Amongmicroarrayanalysismethods，clusteringalways widely-used researchersthink extract effectivelyunderlying one．Many principalcomponentanalysis(PCA)Call canbebuiIt a cleardata sm．vcturesindamand noises．1f structure，the suppress clustering upon ofreSUItscanbe the of interact reliability improved．However,givenspecialtymicroarraydata，genes before witheachotherandarcnot PCAshouldbeused independentlyexpressed。Therefore。whether in hasbecomeanissuetobediscussed．Wethreesetsof clusteringmicmarrayanalysis