微卫星DNA进化特征研究进展_柳莹精选.pdfVIP

2014 年，第33卷，第6期，第 1391-1400页 基因组学与应用生物学， GenomicsandAppliedBiology,2014,Vol.33,No.6,1391-1400 评述与进展 ReviewandProgress 微卫星DNA进化特征研究进展 * 柳莹 唐永政 高丽 烟台大学,烟台,264005 *通讯作者,liuyinger@ 摘 要 在过去的20 年间，微卫星分子标记因其在基因组内存在广泛且多样性程度高，而得到了日益广 泛的发展与应用。对于一个遗传标记而言，其多样性水平的产生应与其进化机制密切相关。虽然对于微卫 星的进化机制与功能目前已经有了一些较为确定的了解，但是总体而言，这个研究领域仍然充满了令人困 惑的争论。尽管微卫星通常被认为是选择中性的标记，但仍不能排除自然选择在其进化过程中起的作用。 本文主要阐述了微卫星序列的结构特征、形成机制、突变原理及影响因素以及在基因组中的作用，并初步 探讨了自然选择在微卫星的进化过程中可能起到的作用。 关键词 微卫星,进化,分子遗传学 TheResearchProgressonEvolutionofMicrosatellites * LiuYing TangYongzheng GaoLi YantaiUniversity,Yantai,264005 *Correspondingauthor,liuyinger@ DOI:10.13417/j.gab.033.001391 Abstract Inthe past 20years,microsatellitehasbeen widelyusedbecauseofitsubiquitous occurrenceand hypervariability. As a genetic marker, its polymorphic level should be closely related to its evolutionary mechanisms.Althoughwehavesomeunderstandingabouttheevolutionandfunctionofmicrosatellite,thereare stillmanyperplexingdiscussioninthisresearch field.Microsatelliteisusuallyconsidered asakindofneutral marker,butwecantexcludethefunctionofnaturalselectioninitsevolutionprocess.Thisreviewdescribed the molecularstructureofmicrosatellite,themechanismsofgenesisandmutationanditsfunctioninthegenome.The rolesplayedbynaturalselectioninitsevolutionprocesswerealsodiscussed. Keywords Microsatellite,Evolution,Moleculargenetics 在所有生物的基因组中，核苷酸序列的重复都是 但是其传统开发过程须经历文库的构建、克隆的筛 一个有趣的特征。这些序列在基因组中占据了相当的 选、序列的测定、引物的设计等环节，因而是一个较 比例，多数位于DNA 的非编码区，AT含量较高，在介 为昂贵、繁琐的过程(Hoshinoetal.,2012)。 质氯化铯中作密度梯度离心，可在主带之外形成小的 生物技术的发展为微卫星的研究提供了有力的 卫星带，因而得名卫星DNA。根据重复序列的长度可 工具。随着第二代高通量测序技术的出现，许多物 以将卫星DNA 分为小卫星或微卫星DNA。微卫星 种的全基因序列得到测定，这使得微卫星在基因组 DNA，或简单重复序列(simplesequencerepeat,SSR) 中的发生及分布相关特征的研究成为可能。大量物 是一类由1~6个核苷酸串联重复形成的DNA序列， 种的DNA 片段纷纷得以测定。在公共数据库中，每 在原核生物和真核生物基因组分布广泛且呈现出较 天都有数万个表达序列标签(expressedsequencetag, 高的多态性水平，因而被开发成为分子标记并得到 EST)得以公布。EST 是指对cDNA文库随机挑取的 了广泛的应用(Tothetal.,2000)。同其它分子标记相 克隆进行大规模测