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微生物分类、命名和鉴定 微生物分类 微生物命名 P130-136 微生物鉴定 基本步骤： 1.获得该微生物的纯种培养物 2.测定一系列必要的鉴定指标 3.查找权威性的鉴定手册 不同种类微生物应采用不同的重点鉴定指标： 真菌：形态特征较丰富、细胞体积较大，以形态特征为主要指标 放线菌、酵母菌：形态特征与生理特征兼用 细菌：形态特征较缺乏，使用较多的生理、生化和遗传等指标 通常把鉴定微生物的技术分成四个不同水平：①细胞的形态和习性水平，例如用经典的研究方法，观察细胞的形态特征、运动性、酶反应、营养要求和生长条件等。②细胞组分水平，包括细胞组成成分例如细胞壁成分，细胞氨基酸库，脂类，醌类，光合色素等的分析，所用的技术除常规实验室技术外，还使用红外光谱、气相色谱和质谱分析等新技术。③蛋白质水平，包括氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学反应等若干现代技术。④基因或DNA水平，包括核酸分子杂交（DNA与DNA或DNA与RNA），G＋C mol%值的测定，遗传信息的转化和转导，16S rRNA（核糖体RNA）寡核苷酸组分分析，以及DNA或RNA的核苷酸顺序分析等。 微生物鉴定技术 经典分类鉴定技术 微生物的形态特征 微生物的生理生化特性 微生物的生态特性 血清学试验与噬菌体分型 现代分类鉴定技术 细胞化学成分分析鉴定法 核酸的碱基组成和分子杂交 微生物全基因组序列 遗传重组 氨基酸顺序和蛋白质分析 微生物的微量、简便、快速或自动化鉴定技术 1.经典分类鉴定技术 主要指标： 微生物的形态特征 微生物的生理生化特性 微生物的生态特性 血清学试验与噬菌体分型 1.1微生物形态特征 形态学特征始终被用作微生物分类和鉴定的重要依据之一，其中有两个重要原因：一是它易于观察和比较，尤其是在真核微生物和具有特殊形态结构的细菌中；二是许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对的稳定性。 主要内容： ①培养特征 ②细胞形态 ③特殊细胞结构 ④细胞内合物 ⑤染色反应 ⑥运动性 ①培养特征 ②细胞形态 形态：球形、杆状、弧形、螺旋形、丝状、分枝及特殊形状 大小：其中最重要的是细胞的宽度或直径 排列：单个、成对、成链或其他特殊排列方式 ③特殊细胞结构 有无鞭毛、芽孢、荚膜（糖被）、菌胶团 孢子：形状、大小、颜色、着生位置、数量及排列 ④细胞内含物 硫粒、异染颗粒、伴孢晶体、气泡等 ⑤染色反应 革兰氏染色 ⑥运动性 1.2微生物的生理生化特性 生理生化特征与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关，酶及蛋白质都是基因产物，所以，对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较，加上测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多，因此生理生化特征对于微生物的系统分类仍然是有意义的。 原核生物的属和种，仅仅根据形态学特征是难以区分和鉴别的，所以生理生化特征往往是分类鉴定的主要特征。 1.2微生物的生理生化特性 ①营养类型 ①光能无机自养型（光能自养型） ②光能有机异养型（光能异养型） ③化能无机自养型（化能自养型） ④化能有机异养型（化能异养型） ②对碳源的利用 对各种单糖、双糖、多糖以及醇类、有机酸等的利用 ③对氮源的利用 对蛋白质、氨基酸、含氮无机盐、N2等的利 用 1.2微生物的生理生化特性 ④对生长因子的需要 对特殊维生素、氨基酸等的依赖性 ⑤对氧的要求 好氧、微好氧、耐氧、厌氧及兼性厌氧 ⑥对温度的适应性 最低温、最适温、最高温、产物积累温度 ⑦对pH的适应性 在一定pH条件下的生长能力及生长的pH范围 1.2微生物的生理生化特性 ⑧对渗透压的适应性 对盐浓度的耐受性或嗜盐性 ⑨对抗生素及抑菌剂的敏感性 ⑩代谢产物 各种特征性代射产物：如色素、有机酸、产气、硫化氢、明胶液化作用 如大肠菌群乳糖发酵，产酸、产气 1.3微生物的生态特性 在自然界的分布情况 与宿主关系：共生、寄生、致病性等 宿主种类 有性生殖情况 生活史 1.4 血清学试验与噬菌体分型 ①血清学试验 细菌细胞和病毒等都含有蛋白质、脂蛋白、脂多糖等具有抗原性的物质，不同微生物抗原物质结构不同，赋予它们不同的抗原特征。常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、亚种或菌株。 通常是对全细胞或者细胞壁、鞭毛、荚膜或粘液层的抗原性进行分析比较。 虽然血清学试验被广泛用于微生物分类鉴定的研究，但比较成功的应用是对种内（以及个别属内）不同菌株血清型的划分。 1.4 血清学试验与噬菌体分型 ②噬菌体分型 在原核生物中已普遍发现有相应种类的噬菌体。噬菌体对宿主的感染和裂解作用常具有高度的特异性，即一种噬菌体往往只能感染和裂解某种细菌，甚至只裂解种内的某些菌株。所以，根据噬菌体的宿主范围可将细菌分为不同的噬菌型和利用噬菌