泡泡刺高通量转录组鉴定及其黄酮类代谢途径初步分析-林业科学研究.pdfVIP

林业科学研究　２０１６，２９（１）：６１ ６６ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　文章编号：１００１１４９８（２０１６）０１００６１０６ 泡泡刺高通量转录组鉴定及其黄酮类 代谢途径初步分析 １ １ １ １ １ １ １，２ 马　婧 ，邓　楠 ，褚建民 ，纪　敬 ，史胜青 ，江泽平 ，成铁龙 （１．中国林业科学研究院林业研究所，国家林业局林木培育重点实验室，北京　１０００９１；２．南京林业大学，江苏 南京　２１００３７） 摘要：［目的］为了更好的了解泡泡刺黄酮类生物合成途径及其潜在的抗逆作用，［方法］应用高通量ＲＮＡｓｅｑ测序 技术对泡泡刺当年生新叶进行了转录组测序及相关生物信息学分析。［结果］表明：泡泡刺当年生叶中获得了 ｏｔａｌｒｅａｄｓ，总核苷酸数为１１７１２０９９６０ｂｐ（１．０９Ｇｂ），组装拼接后得到４８９２１条ｕｎｉｇｅｎｅ序列；Ｎｒ、Ｓｗｉｓｓ Ｐｒｏｔ、ＣＯＧ、ＧＯ、ＫＥＧＧ等数据库分析显示，有３０４０７个 Ｎｒ注释，１９６７１个 Ｓｗｉｓｓｐｒｏｔ注释，９２７３个 ＣＯＧ功能注释， ４６１５３个ＧＯ功能注释，１３６５４个ＫＥＧＧ注释，并从ＫＥＧＧ通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段 １８６个。［结论］本研究获得了较好的泡泡刺转录组序列信息，并且其中富含黄酮类化合物代谢途径的相关基因，这 为其抗逆机制、药用价值的研究及开发利用提供宝贵资源。 关键词：泡泡刺；转录组；ＲＮＡｓｅｑ；黄酮类化合物 中图分类号：Ｓ７１８．５ 文献标识码：Ａ ＨｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄＦｌａｖｏｎｏｉｄｓ ＭｅｔａｂｏｌｉｃＰａｔｈｗａｙｓｉｎＮｉｔｒａｒｉａｓｐｈａｅｒｏｃａｒｐａ １ １ １ １ １ １，２ ＭＡＪｉｎｇ，ＤＥＮＧＮａｎ，ＣＨＵＪｉａｎｍｉｎ，ＪＩＪｉｎｇ，ＳＨＩＳｈｅｎｇｑｉｎｇ，ＪＩＡＮＧＺｅｐｉｎｇ，ＣＨＥＮＧＴｉｅｌｏｎｇ （１．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＴｒｅｅＢｒｅｅｄｉｎｇａｎｄＣｕｌｔｉｖａｔｉｏｎ，ＳｔａｔｅＦｏｒｅｓｔｒｙＡｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ，ＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ，Ｃｈｉｎｅｓｅ ＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ，Ｂｅｉｊｉｎｇ　１０００９１，Ｃｈｉｎａ；２．ＮａｎｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ　２１００３７，Ｊｉａｎｇｓｕ，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：［Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ］Ｔｏｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｔｈｅｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃｐａｔｈｗａｙｏｆｆｌａｖｏｎｏｉｄｓａｎｄｉｔｓｒｏｌｅｓｉｎｔｈｅａｄａｐｔａｔｉｏｎｔｏａｂｉｏｔ ｉｃｓｔｒｅｓｓｅｓｉｎＮｉｔｒａｒｉａｓｐｈａｅｒｏｃａｒｐａ．［Ｍｅｔｈｏｄ］ＨｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔＲＮＡｓｅｑｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｗａｓｕｓｅｄｔｏｇｅｎｅｒａｔｅｔｈｅｔｒａｎ ｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆｃｕｒｒｅｎｔｙｅａｒｌｅａｖｅｓ，ａｎｄｔｈｅｎｔｈｅｒｅｌａｔｅｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｗａｓｐｅｒｆｏｒｍｅｄ．［Ｒｅｓｕｌｔ］Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅｄｔｈａａｗｒｅａｄｓａｎｄ４８９２１ｕｎｉｇｅｎｅｓｗｅｒｅａｃｑｕｉｒｅｄａｆｔｅｒｄｅｎｏｖｏａｓｓｅｍｂｌｙ；３０４０７ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ ｗｅｒｅａｃｑｕｉｒｅｄｆｒｏｍＮｒｄａｔａｂａｓｅ，１９６７１ｆｒｏｍＳｗｉｓｓＰｒｏｔｄａｔａｂａｓｅ，９２７３ｆｒｏｍＣＯＧｄａｔａｂａｓｅ，４６１５３ｆｒｏｍＧＯｄａ ｔａｂａｓｅａｎｄ１３６５４ｆｒｏｍＫＥＧＧｄａｔａｂａｓｅａｆｔｅｒｆｕｎｃｔｉｏｎａｎｎｏｔａｔｉｏｎａｇａｉｎｓｔｆｉｖｅｄａｔａｂａｓｅｓ；１８６ｕｎｉｇｅｎｅｓｗｅｒｅａｓｓｏｃｉａｔ ｅｄｗｉｔｈｆｌａｖｏｎｏｉｄｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ