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密级
· 学校代码 !Q5垒2 学号2QQ814020003
湖南省部分两栖动物的线粒体
DNA条形码及分子系统发育研究
DNAB andMolecular of
arcoding Phylogeny
Several iansinHunan
Amphib Province
指导教师姓名、职称 墅堂建鏊筮
研 究 方 向.墅生边堑堡直鱼型周
湖南师范大学学位评定委员会办公室
二零一一年四月
{IlIIIIII IIIIII IIIillllIIl
911 1
|Y193
中文摘要
线粒体是绝大多数真核生物细胞内的一种基本的、重要的细胞
器,是进行有氧呼吸的主要场所。脊椎动物的线粒体DNA
(mitochondrial
行严格的自我复制,具有母系遗传特征,在世代传递过程中不会发生
基因重组【11。mtDNA已被广泛应用于脊椎动物进化遗传学和种群遗
传学的研究,为在分子水平上解决物种的系统发育问题提供了很好的
coxidasesubunit
cytochrome I)为研究对象,对湖南省的部分两栖动
物的分类和系统发育问题进行了研究。
研究克隆了11种两栖动物COI基因的DNA条形码区域,11个
物种均获得了650
的方法比较了这些动物COI基因的遗传相似性和序列差异并构建了
不同物种中—6m含量都高于G忙含量,从密码子的使用频率来看,
密码子第一位碱基G的使用频率最低,第三位T的使用频率最高,
这说明碱基以及密码子的使用具有一定的偏向性。(2)遗传相似性在
55.4.98.6%之间,序列差异在1.5.33.7%之间。泽蛙和棘腹蛙的COI
基因的遗传相似性最高,中华蟾蜍和花姬蛙的遗传相似性最低。大鲵
和沼蛙的序列差异最大;泽蛙和棘腹蛙的序列差异性最小。(3)从分
来看,蛙科、树蛙科、姬蛙科与蟾蜍科的各物种分别聚
类,与传统分类学是一致的,说明用COI基因来鉴别物种是较理想
相似度很高,但也有区别比较大的序列,这有可能是由于不同的亚种、
个体差异、地理隔离等原因导致的,从另一方面来说COI基因可能
对相同物种的不同亚种也有很好的鉴别能力【3-5】。
通过以上的分析证明COI基因条形码在这些物种中有较好的鉴
别能力,并能够很好的反应两栖纲各物种间的遗传关系,这与传统的
物种分类是相一致的。
关键词:DNA条形码;COI基因;两栖纲;物种分类
II
Abstract
Mitochondrialis an inmostof
importantorganelleexisting
cells.VertebratemtDNAisaclosedcirculardouble
eucaryote strand
is inastrictmaternalinheritance
DNA,which
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