免疫组化的图象分析精选.pdfVIP

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免疫组化的图象分析精选

免疫组化的图象分析 我这里说的免疫组化图片,是这样的一类图片:染上的颜色是黄色,如果染得浓,就呈现棕黄色。 (制作样品的过程可别问我。我不知道) 要比较 不同切片的光密度值来确定它们之间的蛋白表达的差异,首先要注意的就是这些切片样品要 用尽可能完全一致的方法来处理。最近看到一个新技术挺不错,就是把各个样品定位后,各切出一 个小细条,整整齐齐排成一个阵列,包埋在蜡块中,切成一片切片,然后进行免疫组化反应及染色 处理。这样在一个载玻片上就有了数百个小切片,不仅它的的切片染色条件一致,还节省了抗体试 剂。 切片当然首先得拍成照片才能进行分析。拍照也是一个重要环节,在显微镜下拍摄免疫组化照片需 要注意以下几个要点: 1. 所有照片必须在完全同样的显微镜条件下拍摄,在更换样品时,除了调整焦距和视野外,显微镜 上的其他部件都不能动!所有的样品必须一次拍摄完全。特别是在拍 摄过程中,不要一会用高倍 镜,一会用低倍镜,来回切换物镜。当然,在使用高倍镜时对焦及寻找视野会稍麻烦一点,但也没 办法。保持各张切片的拍摄条件一致更 重要。 2.数码相机必须设置为手动曝光,并且保持每张照片用同样的曝光条件,同样的曝光时间,同样的 光圈。特别要注意的是,一定要将数码相机的自动白平衡功能给关掉!!! 3. 免疫组化切片一般染色不太深,因此拍摄出的照片颜色较浅,就让它浅。拍摄出的照片中空白部 位应尽可能呈现纯白色。测量其灰度应在230-240之间。如果 呈现淡蓝色,一般是相机自动白平衡 在起作用。另外一个因素是显微镜灯光电压不正确。要使灯光本身的色温正确。既不偏黄,也不偏 蓝。下面两张照片中左边一张 是合适的曝光,右边那张不好。 打开要分析的图片后首先要进行光密度校正。 点开intensity calibration窗口后,选std option density,并点option按纽,在弹出的窗口 里点insident旁边的image按纽。弹出第三个窗口后,将鼠标移到图片的空白处点一下,就可 以 看到current value的值会显示出点击部位的灰度值。白色的背景能达到250左右,而拍得较暗的 照片或者背景偏蓝的照片则只有200甚至更低。 一张照片的背景强度不会是完全一样的。所以要在照片各个不同的空白处都点一下,看看它们的值 差别大不大。许多相机拍的显微镜照片是中间稍亮,四周暗。所以最后确定的背景值只能是取它们 的折中。 较正背景的值会在曲线的X轴端中表现出来。 光密度校正窗口可以放在屏幕上随时检查,有时候在切换了图片后其光密度校正值会有变化。 现在可以调出count/size窗口,先选择测量项目,前面说过density mean是不合适的测量参数, IOD也有点误差,不过这是系统误差,对半定量分析的影响不大。所以可以选用IOD与area两个测 量项目。当然把选中区域转换成灰度图片再测量更好。 另外对option也要适当设置一下。 然后要保存count/size窗口的设置,点count/size窗口的 file -- save settings,将当前的测量 设置文件保存,最好与图片文件存在同一个文件夹里,免得以后找不到。文件扩展名是 .env 。保存 这个文件的目的是为了制作宏操作用的。 下面就可以选择颜色了,点select colors ,取HSI颜色系统,S与I都选0到 255,H选0到30左 右。这基本上包括了黄色区域。 然后也要保存颜色设置文件。 下面就可以测量光密度值了,点count,然后到statistics窗口中查看测量值。 IOD SUM 与area SUM是有意义的测量值。IOD

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