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生物技术本科PCR方法在ApoE基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用
湖北中医药大学本科生毕业论文
题 目:PCR方法在ApoE基因敲除小鼠
基因型鉴定中的应用
姓 名:
学 号:
专 业: 生物技术
年 级: 2008级
实习单位: 武汉大学心血管病研究所
指导老师:
完成日期: 2012 年 5 月 1 日
PCR方法在ApoE基因敲除小鼠基因型鉴定中的应用
作者 肖明瑶 指导者 张艳
摘 要 目的 为ApoE基因敲除鼠探索快速、简单的基因型PCR检测方法。方法 设计两对引物扩增野生型 ApoE基因和ApoE缺陷突变基因的DNA片段,用PCR仪梯度方案测试最佳退火温度,然后用PCR鉴定方案检测小鼠基因型并将所得基因型结果与已经过经典的 Southern blot方法检测得到的基因型结果比较。结果 野生型仅在155 bp处有一条条带,突变纯舍子仅在245 bp处有一条条带,杂合子则在155和245bp处出现两条条带。用PCR方法获得的ApoE基因分析结果与经典的Southern blot方法获得的结果完全一致。结论 用PCR方法分析ApoE基因敲除鼠的基因型具有快速、简单、廉价和适用的特点。
关键词 聚合酶链反应 基因型 基因打靶 载脂蛋白E
Genotype identification of ApoE Gene Knockout Mice with Polymerase Chain Reaction
Objective This study was to explore a simple and quick polymerase chain reaction(PCR)method for genotyping of ApoE knockout mice.Method Two pairs of primers were designed to amplify genomic DNA fragment of wild-type ApoE gene and the same region on ApoE targeting veceor respectively.A gradient PCR strategy was used to test the best annealing temperature. Results A 155bp band was found in wild-type ApoE mice,a 245 bp band in homozygous mutated ApoE mice and both bands in hetemzygous mice.The genotyping results were completely coincided with those from typical Southern blot. Conclusion PCR is a simple,fast and practical method for the genotyping of ApoE gene knockout mice.
Key words Poiymerase Chain Reaction genotype gene targeting ApoE
载脂蛋白(apolipoprotein,ApoE是清除乳糜微粒和极低密度脂蛋白的受体的配体,因此,缺乏ApoE则会导致血液循环中富含胆同醇的物质积累而更加容易引起动脉粥样硬化(atl-rosclerosis,AS)病灶形成。ApoE基因敲除小鼠亦称ApoE基因缺陷小鼠,由美国洛克菲勒大学生化遗传与代谢实验室和北卡罗莱那大学病理遗传实验室应用胚胎干细胞基因敲除(gene knockout)技术于1992年培育成功;这种小鼠无论正常或高脂饮食均可形成严重的高脂血症及AS病灶。此后,各国学者利用ApoE基因敲除小鼠在高脂血症及AS的发病机理和治疗措施等方面做了许多卓有成效的研究。为了深入研究基因敲除小鼠表型的改变,基因敲除动物在用于实验研究前,必须准确、及时地进行基因型鉴定。由于需要鉴定的动物数量多,工作量大,而传统的Southern blot方法费时、昂贵,又涉及同位素可能对环境的污染,不便于进行大规模的动物筛选。我们采用聚台酶链反应(poiymerase ch
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