吉林省烟草野火病菌群体分子多态性分析 Analysis of Molecular Polymorphism of Pseudomonas syringae pv. tabaci in Jilin Province.pdfVIP

吉林农业大学学报　 ２０１４，３６（５）：５２４～５２９ ｈｔｔｐ：／ ／ ｘｕｅｂａｏ．ｊｌａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｊｌｎｄｘｂ＠ｖｉｐ．ｓｉｎａ．ｃｏｍ 吉林省烟草野火病菌群体分子多态性分析∗ ∗∗ ∗∗ 夏纬跃，卢宝慧，杨丽娜，南　 楠，刘燕妮，陈长卿 ，高　 洁 吉林农业大学农学院，长春 １３０１１８ 摘　 要：为研究烟草野火病菌的群体遗传多样性，采用正交试验方法，对５个多态性引物（ＲＥＰ，ＥＲＩＣ，ＢＯＸ， ２＋ － Ｊ３，ＩＳ１１１２）的Ｒｅｐ ＰＣＲ反应体系分别进行了优化，同时优化了体系中的Ｍｇ 、ｄＮＴＰ、ｒＴａｑ 酶等几个因素，并 在此基础上对来源于吉林省不同地区的７０株烟草野火病菌进行了分子多态性分析。 结果表明：优化的ＰＣＲ 反应体系电泳图谱清晰，多态性丰富，重复性好，适合烟草野火病菌群体分子标记研究。 通过聚类分析发现， 吉林省烟草野火病菌群体存在分子多态性，在遗传相似系数为０９ 时，７０个菌株被聚为４ 个类群（Ｇ１～Ｇ４）， 其中Ｇ１类群最大（３９个菌株，占５５７１％），而Ｇ３类群最小，仅包括２个菌株。 Ｇ１和Ｇ２ 类群分别包含了５个 和３个亚群。 不同类群和亚群的菌株地理来源存在多样性。 － 关键词：烟草野火病菌；Ｒｅｐ ＰＣＲ体系优化；分子多态性 中图分类号：Ｓ４３５７２　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃５６８４（２０１４）０５⁃０５２４⁃０６ ＤＯＩ：１０．１３３２７／ ｊ．ｊｊｌａｕ．２０１４．１９９４ 引文格式：夏纬跃，卢宝慧，杨丽娜，等．吉林省烟草野火病菌群体分子多态性分析［Ｊ］．吉林农业大学学报， ２０１４，３６（５）：５２４⁃５２９． Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｏｆ Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｙｒｉｎｇａｅ ｐｖ． ｔａｂａｃｉ ｉｎ Ｊｉｌｉｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ ＸＩＡ Ｗｅｉ⁃ｙｕｅ，ＬＵ Ｂａｏ⁃ｈｕｉ，ＹＡＮＧ Ｌｉ⁃ｎａ，ＮＡＮ Ｎａｎ，ＬＩＵＹａｎ⁃ｎｉ，ＣＨＥＮ Ｃｈａｎｇ⁃ｑｉｎｇ，ＧＡＯ Ｊｉｅ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｏｎｏｍｙ，ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ １３０１１８，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｏｓｔｕｄｙｔｈｅｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｓｙｒｉｎｇａｅｐｖ．ｔａｂａｃｉ，ｔｈｅｏｒｔｈｏｇｏ⁃ ４ ２＋ ｎａｌ ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ Ｌ （３ ）ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ｏｐｔｉｍｉｚｅ ＰＣＲ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ Ｍｇ ，ｄＮＴＰ，ｒＴａｑ ９ ＤＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ａｎｄ ｐｒｉｍｅｒｓ ｏｆ ｆｉｖｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｐｒｉｍｅｒｓ（ＲＥＰ，ＥＲＩＣ，ＢＯＸ，Ｊ３ ａｎｄ ＩＳ１１１２）． Ｍｏ⁃ ｌｅｃｕｌａｒ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｏｆ ７０ ｓｔｒａｉｎｓ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｆｒｏｍ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ａｒｅａｓ ｉｎ Ｊｉｌｉｎ ｐｒｏｖｉｎｃｅ ｗａｓ ａｎａｌｙｚｅｄ ｕｓｉｎｇ － ｔｈｅ ｏｐｔｉｍｉｚｅｄ Ｒｅｐ ＰＣＲ ｓｙｓｔｅｍ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅ