栉孔扇贝在镉污染胁迫下消化盲囊组织的转录组分析.pdfVIP

中国水产科学 2017 年7 月, 24(4): 802-810 Journal of Fishery Sciences of China 研究论文 DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.16232 栉孔扇贝在镉污染胁迫下消化盲囊组织的转录组分析 1, 2 1, 2 1, 2 1, 2 1, 2 张辉 , 翟毓秀 , 姚琳 , 江艳华 , 李风铃 1. 农业部水产品质量安全检测与评价重点实验室, 中国水产科学研究院 黄海水产研究所, 山东 青岛 266071; 2. 农业部水产品质量安全风险评估实验室(青岛), 山东 青岛 266071 摘要: 镉(Cd)作为生物非必需、毒性极强的蓄积性重金属, 易通过食物链进入人体, 严重威胁人类健康。扇贝相对 于其他贝类具有特异性蓄积镉的能力, 成为水产品安全领域关注的焦点。为了阐释扇贝高蓄积镉的分子机制, 本研 究以镉胁迫的栉孔扇贝(Chlamys farreri)消化盲囊组织为研究对象, 通过转录组测序技术进行基因转录水平分析。 通过比较转录组拼接获得 105071 个unigene 和3800 个差异基因, 对所得unigene 进行功能注释, 发现这些基因集 中在蛋白绑定、细胞黏附、免疫应答、细胞凋亡和能量代谢等方面。对这些蛋白的分子功能进行注释, 发现该类 蛋白主要属结合蛋白(40.45%) 、催化活性蛋白(34.27%)和转运蛋白(5.62%) 。这些功能基因和预测通路为理解扇贝 体内解毒和免疫系统奠定了基础。获得的转录组数据为深入研究双壳贝类应对海洋污染物的分子机制提供了丰富 的基因资源。 关键词: 栉孔扇贝; 镉; 比较转录组; 差异表达基因 中图分类号: S94 文献标志码: A 文章编号: 1005-8737-(2017)04-0802-09 栉孔扇贝(Chlamys farreri)是中国北方沿海省 组织(WHO)确定的优先研究的污染食品的 17 种 份广泛养殖的重要经济物种。近年来, 由于各种 毒物之一, 也是毒性最大的重金属之一[9] 。根据 原因, 比如高温或者人类活动引起的环境污染, 2001—2005 年的生态评价, 渤海湾的镉污染非常 导致扇贝养殖被大规模破坏[1] 。很多化学污染物, [10] 严重 。镉污染已经成为影响水产品质量与安全 包括石油产物、生活和城市垃圾、有机氯化合物、 的主要问题之一, 尤其对于扇贝。因此, 理解扇贝 重金属等, 即使以低水平释放, 仍被认为对养殖 的毒性机制极为必要。 环境具有严重的副作用[2] 。扇贝由于滤食特性对 近年来, 二代测序技术被成功应用于基因分 重金属具有生物累积性。之前针对贝类的相关研 析、差异基因筛选、无参考基因组信息或非模式 究主要集中在抗氧化酶活性[3] [4] [11] , 脂质过氧化 , 生物中新转录本的发掘等 。例如, RNA-seq 测 [5] [6] 组织中生物累积量 , DNA 链断裂 , 基因标志 序被应用于各种无脊椎动物中, 像中华绒螯蟹 物发掘等[7– 8] 。然而, 这些研究受限于基因组资源 (Eriocheir sinensis) 、桔小实蝇(Bactrocera dorsa- 的缺乏。对扇贝转录组表达谱的全面了解有助于 lis) 、马氏珠母贝(Pinct