SSR分子标记在甘蔗遗传育种中研究现状.ppt

SSR 标记在作物遗传育种中的应用;主要内容;分子标记背景;SSR的概念;SSR标记技术的原理;GA;SSR标记技术的特点;然而 SSR 标记技术也有其缺陷： 主要在于 SSR 座位突变率高，对变异反应非常敏感，所以易受到趋同变异引起的平行演化程度的影响，从而给物种间亲缘关系的评估带来误差。 同时 SSR 是必须针对每个染色体座位测定并找到 SSR 两端寡聚核苷酸来设计引物，较费时耗力。;SSR标记技术的技术要点;文库法是经典的 SSR 引物设计方法，其过程为： 首先建一个基因组文库 提取基因组 DNA 限制性内切酶或超声波处理获得 DNA 片段 将 DNA 片段接入噬菌体或质粒中 用放射性同位素或地高辛标记的含有 SSR 序列的寡聚核苷酸探针筛选文库 对筛选出的阳性克隆测序 选择序列较长且 SSR 序列位点偏向序列中部的 SSR 序列两端的侧???序列设计引物（一般为 20～25 个碱基对）。;富集法是由文库法改进而来的。 首先建一个小插入片段基因组文库，再使用含重复序列的寡核苷酸引物或探针对该基因组文库进行富集筛选，使用筛选出的阳性克隆构建一个富集文库。 而后的基因文库筛选、阳性克隆测序和引物设计过程与文库法的一致。; 近缘物种间共用引物法是指研究者可以使用与目标物种具有较近亲缘关系的其他物种（同科不同属或同属） 的 SSR 序列引物来设计 SSR 标记引物或直接进行 SSR 分子标记的方法。 生物信息学法是指研究者使用 SSR 序列搜索软件在基因组数据库或报道文献中搜索相关的基因序列和表达序列标签（EST）序列， 从而获得 SSR 序列信息来设计所需的引物。;PCR扩增;增产物的分离和检测;SSR标记技术在育种中的应用;亲缘关系和遗传多样性的研究;遗传连锁图谱构建;DNA 指纹和品种鉴定;分子标记辅助育种;SSR标记技术未来发展;谢谢大家！