生物芯片技术及其应用-生科院研究生课程1.pptVIP

近年Medline收录的发表的“DNA microarray” 相关论文 寡核苷酸芯片——探针的设计（一） 特异性（与非目标基因的相似性要低于75%） GC含量（35%~65%) 无多聚结构 Tm值在70～90度 长度（40~60bp) Blast 序列比对 Mfold 判断多聚结构及发夹结构 OligoDesign * 生物芯片技术及其应用 生物芯片上海国家工程研究中心 肖华胜博士 第一部分 概述 第二部分 基因芯片 第三部分 蛋白芯片 第四部分 组织芯片 第五部分 其他形式的芯片 第一部分 概 述 生物芯片的概念是Fodor等人于1991年提出(Fodor et al., 1991, Science)。 生物芯片的概念：是借用电子芯片的概念，是指能够快速并行处理多个样品并对其所包含的各种生物信息进行解剖的微型器件，它的加工运用了微电子工业和微机电系统加工中所采用的一些方法，只是由于其所处理和分析的对象是生物样品，所以叫生物芯片(Biochip)。 高通量，平行化，微量化的分析手段。 生物芯片的分类 基因芯片 　　　　　　　　　　　　　 cDNA芯片 Oligo芯片 　　　　　 信息生物芯片 　　　　　　 　蛋白芯片 生物芯片 　 微流体芯片 功能生物芯片 　　　　　　 芯片实验室 组织芯片 （微阵列芯片） （微流控芯片） 生物芯片的发展历史和趋势（一） 1991提出生物芯片的概念； DNA芯片： 在90年代初期，利用光原位合成的原理，在基质上固定高密度的寡核苷酸的DNA测序芯片。 1995年Schena (Science, 1995)等人，把拟南芥的45个基因固定在一张玻片上，并行检测拟南芥45个基因的表达情况，这是第一次结合了高精度机械手点样系统、荧光标记技术、双通道荧光扫描技术和数据分析软件，是第一次真正意义上的用DNA芯片技术进行基因表达分析的应用。 部分基因组被测序的微生物全基因的DNA芯片问世，如：酿酒酵母，大肠杆菌。 人类、大鼠和小鼠的全基因组芯片。 生物芯片的发展历史和趋势（二） 生物芯片的发展方向主要有：无标记杂交信号检测；高度自动化的杂交流水作业系统；强大的数据处理软件。 生物芯片发展的最终目标：是将样品制备、生化反应到检测的整个分析过程集成化，以获得所谓的微型全分析系统或称缩微芯片实验室（Lab-on-a-chip)。 蛋白芯片： 90年代初期报道的微斑免疫分析法中，所有抗体圆斑的直径只有10 μm，并用了激光共聚焦显微镜来检测标记抗体的荧光。 2001年Zhu等人，克隆了酵母菌中编码蛋白质的5800个开放阅读框，在载体中表达出了各自的编码蛋白，并把这些蛋白印制到聚二甲基硅氧烷（PDMS)上，制成高密度的酵母蛋白组微阵列。 Clontech公司推出500个抗体的抗体芯片。 其他的芯片： 如芯片毛细管电泳、PCR反应芯片、介电电泳芯片等。 生物芯片 药物机理研究 功能基因组研究 农林业 药靶发现 突变检测 军事、司法 疾病分子诊断 生物芯片技术的应用领域 ……. ……. 药物筛选 药物开发 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03 04 5 14 6 11 36 193 649 1994 3383 3703 4602 5000 4000 3000 2000 1000 基因芯片(Gene chip)技术是指通过微阵列(Microarray)技术将高密度DNA片段通过高速机器人或原位合成方式以一定的顺序或排列方式使其附着在如膜、玻璃片等固相表面，以同位素或荧光标记的DNA探针，借助碱基互补杂交原理，进行大量的基因表达及监测等方面研究的最新革命性技术。 第二部分 基因芯片 转录组 功能基因组学 基因芯片是功能基因组学研究的重要技术 EST测序 基因芯片 SAGE 其它 差异显示、RDA Northern Blot 基因组 蛋白质组 (DNA) (RNA) (Protein) 基因芯片发展过程 Southern Northern Blot Dot Blot Macroarray Microarray cDNA clones (target) PCR product amplification purification printing microarray Hybridise target to microa