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ExPASy网络资源再挖掘 ExPASy网络资源再挖掘 水稻组: 吕桂云张春秋 水稻组: 吕桂云张春秋 龚俊义潘哲超 龚俊义潘哲超 2008 1 年 月 12 日 2008 年 1 月 12 日 第一部分：ExPASy简介 第一部分：ExPASy简介 第二部分：数据库资源挖掘 第二部分：数据库资源挖掘 第三部分：工具资源挖掘 第三部分：工具资源挖掘 第一部分：ExPASy简介 第一部分：ExPASy简介 （1 ）数据库 （1 ）数据库 （2 ）蛋白质分析工具 （2 ）蛋白质分析工具 （3 ）配套基础性服务 （3 ）配套基础性服务 （4 ）网络资源链接 （4 ）网络资源链接 第二部分：数据库信息资源挖掘 第二部分：数据库信息资源挖掘 PROSITE：一部宏大的蛋白质motif字典 PROSITE：一部宏大的蛋白质motif字典 PROSITE数据资源非常丰富,适合于从感兴 PROSITE数据资源非常丰富,适合于从感兴 趣的保守结构入手,获取和分析某个或某一 趣的保守结构入手,获取和分析某个或某一 类具有相同共同保守结构序列的蛋白质信 类具有相同共同保守结构序列的蛋白质信 息. 息. 数据库配套分析预测工具也很实用,它可以 数据库配套分析预测工具也很实用,它可以 动用世界上最大最全的蛋白质motif信息资 动用世界上最大最全的蛋白质motif信息资 源来对待测序列进行全方位扫描,具有较高 源来对待测序列进行全方位扫描,具有较高 的可信度. 的可信度. 窗口命令输入形式具有多样化,适合于不同 窗口命令输入形式具有多样化,适合于不同 层次和不同要求的实验需要. 层次和不同要求的实验需要. Protein related databases Protein related databases Protein 3D structure related databases Protein 3D structure related databases Proteomics databases and links Proteomics databases and links Nucleotide and related databases Nucleotide and related databases Carbohydrates resources Carbohydrates resources Species specific databases (Human/Vertebrates/ Species specific databases (Human/Vertebrates/ Mitochondrion and chloroplast/ Mitochondrion and chloroplast/ Insects/Invertebrates/Plants/Fungi/Bacteria/Vir Insects/Invertebrates/Plants/Fungi/Bacteria/Vir uses and phages/ uses and phages/ Human mutation databases/resources) Human mutation databases/resources) GRAMENE：粮食作物比较基因组学研究和 GRAMENE：粮食作物比较基因组学研究和 QTL研究的最佳乐园 QTL研究的最佳乐园 数据库生物信息手册涉及面相当广,许 数据库生物信息手册涉及面相当广,许 多分门别类的生物学网络资源定能够 多分门别类的生物学网络资源定能够 成为我们日后实验的得力助手 ﹗ 成为我们日后实验的得力助手 ﹗ 第三部分：分析工具资源挖掘 第三部分：分析工具资源挖掘 DNA→Protein