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现代生物学实验——生化样品的制备与分析教案
蛋白质实验技术模块教案
教学内容:
蛋白质分离纯化与分析 : 每2人一组,共18—19组×2,每组5d,5×9=45学时×2。
DNA的制备与分析 : 每2 人一组,共18~19组×2班,每组2d,2×9×2=36学时。
具体内容:
cytc分离一天。
生物大分子制备的原理2学时。
PAGE,PI—PAGE,SDS—PAGE原理2学时。
Sephadex G100等层析原理2学时。
分离物的Sephadex G100纯化,1.5d。
分离,纯化过程中所获阶段样品的SDS—PAGE跟踪及分度分析,1.5d。
纯化物的进一步分析的设想,2学时。
DNA分离纯化原理及注意事项,2学时。
兔肝DNA的分离纯化,1d。
DNA的理化性质分析, 7学时。
教学目的:
模拟生化大分子制备的全过程开展较为系统性的训练。
掌握现代仪器在生化样品制备与分析中的应用及其原理。
掌握两类生物大分子分离纯化,理化性质分析的基本原理及注意事项。
cytc的分离:
实验方法步骤见教学讲义P21。
各步骤的基本目的与要求:
取材——猪心,要求新鲜,cytc未被破坏,含cytc高,材料易得。
加等量0.145mol/l TCA,使cytc从线粒体膜上解聚下来,使呈酸性可溶状态。
过滤——去杂质。
调PH至7.3——以利于(NH4)2SO4沉淀去杂蛋白,缓慢添加。
第二次加(NH4)2SO4的作用是进一步去除杂蛋白,缓慢添加。
两次添加(NH4)2SO4后,cytc仍呈可溶性。
静置过中午或至少2h,目的是解水合,使蛋白质凝聚成絮状,以利于通过离心方法去沉淀。
加入20%TCA(25mol/l上清)——沉淀cytc。
透析——去掉酸,去小分子,为上Sephadex G100作准备。
透析要求:低温,不漏,换透析液,用Ba+方法检查透析的效果。
离心机:
类型:实验室用与工业用,间歇式与连续式,冷冻式与不冷冻式,地面式与桌式,普通离心机和高速离心机与超速离心机,制备式与分析式。
实验室常用离心机:
普通离心机——台式(3000-16000rpm)和地面式(3000-6000rpm),一般不带冷冻设备,由电机和转子所组成,转速由电压调节器调节。
高速冷冻离心机——台式与地面式,18000-25000rpm,0-4℃。
上述+制冷设备及温度检测器。
超速离心机——地面式,达30000rpm,0-4℃。
上述+真空设备及真空检测器。
转子:角式与水平式转子,角式常用于沉降离心,水平式还常用于梯度离心。
离心原理:利用转子高速旋转时所产生的强大离心力,加速颗粒的沉 淀速度,把样品中不同沉降系数或浮力密度的物质分离开。
F=ω2ω2r。 ω是角速度(弧度/秒)。r是颗粒的旋转半径(厘米)
F是任何颗粒所经受的向外离心力。
RCF=ω2r/980, RCF是相对离心力,单位为G;980是地心引力,单位为厘米/秒2。
RCF=⒈119×10-5n2r, n为每分钟的转数。
处于离心管内不同位置的颗粒所受的离心力不同,常以离心管中点至旋转中心距离为r时所得到相对离心图表示为平均离心力。
离心力的计算使不同转速和不同离心半径的离心,统一到相同的离心中去衡量颗粒在离心中所受外加作用力的大小,以利用因不同离心机,不同转子在使用中所选择的离心时间和转速。
离心时间:t= [(㏑r2-㏑r1)/ ω2]/s
t为样品颗粒完全沉降到离心管底的时间(秒).
S为沉降系数.
r2为旋转轴中心到离心管底部的距离(厘米).
r1为旋转轴中心到样品液液面的距离(厘米).
5.离心方法:
差速离心法: 定义,应用于沉降系数相差一~几个数量级颗粒的分离。
缺点:a.分离效果差,不能一次得到纯颗粒,经再悬浮和再离心(2~3次),才能得到较纯的颗粒。
b.壁效应严重,在离心管一侧会出现沉淀。
c.颗粒被挤压,可能变形,聚集而失活。
(2)梯度离心: 定义,应用于相差较少(20%或更少)或分子量相差三倍的蛋白质。
优点:a.分离效果好,可一次获得较纯颗粒。
b.适应范围广,能象差速离心法一样分离具有沉降系数差的颗粒,又能分离有一定
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