[理学]第8章 量子化学计算方法.ppt

(3) Roothaan 方程 解Kohn-Sham方程的流程图 §8.3 半经验方法 §8.6 计算化学与分子模拟 一、量子化学计算和分子模拟方法简介 二、计算量子化学 I. 分子轨道法简介 (二)、物理模型的三个基本近似 (三)、 LCAO -MO近似 (四)、Roothaan 方程 (1952) II、密度泛函简介 分子轨道法计算演示 一些化合物红外光谱计算结果（从头算法，6-31G(d) ） 反应途径及过渡态计算 基元反应： 势能面和反应途径 势能面无法实验测定。由量子化学计算给出 如何进行反应途径和过渡态搜索？ 常用的量子化学计算方法 III 前沿发展 — QM/MM法Combined ab initio Molecular Mechanics 三、分子计算机模拟 (四)、 MD处理用于单个分子 (无周期边界) MM和MD的比较 2、化学CAD (1?,2?,4?)-4-(1,1-e二甲乙基)-2-烃基环戊羰基酰胺晶体 实验测定与 MD 模拟结果的比较 W. Linert, and F. Renz, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 33, 776(1993) GnRH ( gonadotrophin-releaing hormon, 促性腺释放激素 ) 分子构象理论预测 D.G. Hangauer, in Computer Aided Drug Design, T.J. Perun C.L. Propst ed., Marcel Dekker Inc., New York, p253, 1989. MD预测的顺磁性和反磁性冰晶体结构 O.A Karim A.D.J. Haymet, J.Chem. Phys., 89, 6889(1988)) MD法模拟的熔盐体系 T *~V * 相图 D.A. Young B.J. Alder, J. Chem. Phys., 73, 2434(1980) Ru-Al 合金断裂过程动态模拟 C.S. Becquart , D. Kim, J.A, Rifkin, and P.C.Clapp, Mat. Sci. Engin., A170, 87(1993) 两块晶体界面结构的模拟 FCC单晶硅，?13(150)晶界，晶面倾角 ?＝67.38° 较小晶面倾角 (? = 9.53?)下单晶硅晶界的一种稳定结构 反应物 F- + CH3Cl 能量极小点 1 F-···CH3Cl 过渡态 ( F-···CH3···Cl )- 能量极小点 2 FCH3···Cl- 产 物 FCH3 + Cl- 实例：一个SN2 反应的反应途径和过渡态计算 Electron density in the amino acid system calculated using a quantum-chemistry computer program. The picture shows the surface where the electron density is 0.002 electrons/?3 (meaning that nearly all electrons are inside the surface). The grey scale shows the electrostatic potential at this surface, darker portions representing negative potential. 半胱胺酸分子 等电子密度面 High up in the atmosphere, CF2Cl2 (freon) are destroyed by ultraviolet light. Free Cl atoms are formed, which react with O3 (ozone) and destroy them. The process can be studied using quantum-chemical calculations. Freon Ozone 氟利昂分子破坏大气臭氧层 反应机理的理论计算研究 The electron density around the vitamin C molecule. The colors show the electrostatic potential with the negative areas shaded in red and the positive in blue 维生素C分子的 电子密度与静电势 1986：李远哲：“ 在十五年前，如果理论结果与实验有矛盾，那么经常证明是理论结果错了。但是最近十年则相反，常常是实验错了。…量子力学有些结果是实