[理学]武大张楚富版生化原理第三章蛋白质.pdfVIP

第三章 蛋白质的结构与功能 1 第一节 研究蛋白质空间结构的方法 (1)X-射线衍射晶体结构分析 (2)核磁共振光谱法 (3)生物信息学计算推导 第二节蛋白质的二级结构 二级结构是多肽链的主链有规则的折叠方式，实 际上是指多肽链主链上的原子在空间上的排列。 多肽主链折叠的空间限制： 从理论上讲，一个多肽主链能有无限多种构象。 但是，只有一种或很少几种相对稳定的天然构象。 原因：天然蛋白质主链上的单键并不能自由旋转 3 一、肽基 1. 肽基：组成肽键的4个原子和2个C α几乎处在同一平 面内，又称酰氨平面、肽单位。 2. 肽键的结构特点： （1）肽键具有部分双键性质，不能自由旋转。 （2 ）肽链中的肽键一般是反式构型。 O C α C N C H α 4 二、α-碳原子的二面角 肽基以α-C原子相隔，构成肽链 只有α碳原子连接的两个键（C α—N和C α-C ） 是单键，能自由旋转。 环绕C α—N键旋转的角度为Φ (fai ) 环绕C α—C键旋转的角度称Ψ (psai ) 5 ★当Φ( Ψ)旋转键两侧 的主链呈顺式时，规 定Φ( Ψ) =0 ° ★从C α沿键轴方向 看，顺时针旋转的Φ ( Ψ)角为正值，反之为 负值。 P59 图3 －5 6 Φ和Ψ同时为0 的构象实际不存在 二面角（Φ、Ψ）所决定的构象能否存在， 主要取决于两个相邻肽单位中非键合原子 间的接近有无阻碍。 C α上的R基的大小与带电性质影响Φ和Ψ 7 三、多肽允许的构想可以用拉氏图预测 拉氏构象图： 可允许的Φ和Ψ值 以Φ为横坐标，以Ψ为纵坐标，在坐标图上标出， 该坐标图称拉氏构象图。 8 p60