晶体解析程序SHELX入门.ppt

SHELX的安装 安装SHELXTL到C:\ 将 \shelx98 \xzor 拷贝到C:\ 将autoexce.bat 覆盖原来C:\原有文件 （或者直接对原有文件进行修改） 重启后即可使用 \xzor 里面的xpma显示可能需要进行设置 具体按照readme.1st说明对rad.ls进行调整 我们常用的一些命令 XPREP 98XS (TREF,PATT) XPMA(记住一些快捷键) 98XL(ANIS, ACTA,OMIT) XP (READ,REAP, FMOL, GROW, HADD,KILL,FUSE,SGEN, MPLN,LINK,LABL,MATR,PACK,TELP,VIEW,PERS,DRAW) 98TAB(需要copy两个文件才能运行) EDIT XPREP Xprep or xprep name Need name.hkl then input information of cell parameters (name.p4p)and chemical formula Output name.ins and name.prp 98XS 98xs name or xs name Need name.ins and name.hkl Output name.lst and name.res TREF for direct methods PATT for Patterson methods XPMA Xpmacr crr/p/ecrnamecr Need name.res Output name.ins 98XL 98xl name Need name.ins name.hkl Output name.lst, name.res and name.cif(acta) XP Use HELP How to draw Labl Telp Draw 98TAB 98tab name Need name.cif name.ins name.hkl Output table * * 晶体解析程序SHELX入门 结构分析程序(SHELX)的简介 SHELX主要有以下程序： XPREP：为结构解析准备 .INS文件程序。 XS：直接法和Patterson法解析结构程序。 XL：结构精修程序（包括Fourier合成和最后的结构参数计算程序）。 XP：建立结构模型和绘图程序，图形界面，实时显示。 TAB：给出键长键角等结构数据表格的程序。 XS，XL的不同版本有XS，XLS，XLS3，93XL，97XS，97XL，98XS，98XL。 XPMA：另一套建立结构模型程序。 SHELX的使用 1、准备反射点文件 .HKL，格式一般为h, k, l, Io, ?(I) (3I4, 2F8.2)。 2、使用 XPREP 程序输入晶胞参数（或直接从.p4p读取），进行数据统计和检查消光规律以确定空间群，输入分子式等等，程序结束时输出 .INS。该 .INS文件通常设定了直接法的现行设置。 3、使用 XS 解析结构，读入 .HKL和 .INS文件，结果输出到 .LST和 .RES文件。 4、使用 XP 或 XPMA（或DOS的EDIT）读入 .RES文件，建立初始结构模型，结果输出到 .INS文件，该 .INS文件通常设定了最小二乘法修正和Fourier 合成的设置。 5、使用 XL 读入 .HKL和 .INS文件，进行结构模型的最小二乘法修正和Fourier合成（通常为差值Fourier合成），结果输出到 .LST和 .RES文件。 6、重复4，5过程不断扩展完善结构模型和精修，直到结构修正收敛和偏离因子最低。 7、使用TAB，XP或XPMA进行结构分析结果的表述和输出。 *.P4P和*.HKL 衍射仪收集的衍射方向和衍射强度数据 XPREP * 确定空间群，输入分子式，建立指令文件 *.INS, *.PRP SHELXS *或XS * 用直接法或重原子法试解结构 *.RES, *.LST XP * 或XPMA* 确立初始模型或修改前一轮的模型 *.INS SHELXL *或XL * 修正粗模型，寻找新的电子密度峰 *.RES, *.LST 可用框图表示为 数据准备 初始结构建立 结构修正和扩展 结构结束工作 操作简单 使用鼠标模式 结构模型建立简单 使用较XPMA复杂 使用输入模式 在绘图，复杂结构认定 等方面，优势明显 *