蛋白质二级级结构-北京大学单分子与纳米生物学试验室.PDFVIP

医用生物物理学:膜与生物大分子 期末作业 蛋白质二级级结构 基础医学院生物物理系 余子璘 蛋白质结构的研究很早就受到许多科学家的关注，并提出了多种假说，但是一直没有一个令 人满意的理论。直到 1952 年丹麦生物化学家Linderstrom—Lang第一次提出蛋白质三级结构的概念， 才使蛋白质结构的研究走上了正确的道路。Linderstrom—Lang 的三级结构概念包括:一级结构指多肋 链中氨基酸的一定的顺序，靠共价键维持多脓链的连接，而不涉及其空间排列；二级结构，指多肤 链骨架的局部空间结构，不考虑侧链的构象及整个肽链的空间排列；三级结构则是指整个肽链的折 叠情况，包括侧链的排列，也就是蛋白质分子的空间结构或三维结构。这一概念提出之后，立即被 各国科学家所接受。1958 年，英国晶体学家Bernal在研究蛋白质晶体结构时发现，并非所有蛋白质 的结构都达到三级结构水平．而有些蛋白质则有更复杂的结构，即由几个蛋白质的亚基结合成几何 状排列。许多蛋白质是由相同的或不同的亚基组成，靠非共价键结合在一起．他将这种结构称为四 级结构[3] 。现在蛋白质的一、二、三、四级结构的概念已由国际生物化学与分子生物学协会(IUBMB) 的生化命名委员会采纳并做出正式定义。 蛋白质的一级结构一般是指构成蛋白质肽链的氨基酸残基的排列次序，有时也称为残基的序列。 这一定义对只含氨基酸的简单蛋白是适用的。但是在生物体内还有很多复合蛋白，它们除了氨基酸 外，还有其他的组成。对复合蛋白，完整的一级结构概念念应该包括肤链以外的其他成分(例如糖蛋 白上的糖链，脂蛋白中的脂质部分等) 以及这些非肽肤链部分是以何种方式，接在脓链中哪些残基上。 蛋白质的一级结构是一个无空间概念的一维结构。 蛋白质的一个引入注目的特征是它们都有确定的三维结构。一个伸展的或随机排布的多肽肋链 没有任何生物活性，多肽肤链必须按照一定的规律折叠成三维结构，才具有生物活性。生物功能来 自构象，构象指的是原子在一个分子结构中的三维排布方式。氨基酸序列的重要性在于不同的氨基 酸序列规定了蛋白质的不同构象。 蛋白质构象研究的开创人鲍林(Pauling)和科里(Corey)在 30 年代后期的研究中提出了一个重要的 结论，即蛋白质肽单位的刚性和共面性。如图 1—9 所示。肽单位中碳基碳原子和氮原子之间所成的 键(肽键) 的键长为0.32nm 。这个键长介于单键C—N(0.149nm)和双键 C=N （0.127 间，具有部分双键 的性质，是刚性的。相反，α-碳原子与羰基碳原子之间是单键，。α-碳原子与氮原于之间也是一个 纯粹的单键，因此，在刚性的肽单位两侧的这些键具有充分转动自由。围绕这两个键进行的转动用 角φ和ψ来代表。Φ代表绕C 一C单链的转动；ψ代表绕C 一N单链的转动。如果每一个氨基酸残基的φ α α 和ψ已知，多肽主链的构象就完全确定。 那么，多肽链的构象，或蛋白质的三维结构是由什么决定的?是氨基酸序列决定了蛋白质的三维 结构。这一结论来自 Anfinsen 关于核糖核酸酶的工作。他在对核糖核酸酶变性和复性的实验研究中， 得到了一个重要的结论，规定核糖核酸酶复杂的三维结构所需要的信息包含在它的氨基酸序列中。 以后对其他蛋白质的研究证实了这个原理的普通性。这是分子生物学的一个中心原理：序列规定构 象。 蛋白质肽肤链中局部肽段骨架形成的构象，被称为二级结构。蛋白质的二级结构有不同的类型， 包括α螺旋、β折叠、转角、环形和任意性较大的卷曲。这些二级缀结构按其规则的程度可以归纳为 3 类：α螺旋和β折叠是具有严格规则的一类；任意性较大的卷曲当然是没有规则的一类，转角和环 形则是介乎两者之间的第三类。在一个蛋白质的肽链中，不是所有的肽段都是有规则的二级结构。 一个蛋白质的构象，即肽链中的规则的二级结构和其他无规则的肽段一起，构成的完整立体结构则 是蛋白质的三级结构。就这点而言，蛋白质的二级结构是构成蛋白质三级结构的部件。一条肽链或 少数几条肽链通过共价键构成的蛋白质立体结构通常是指它们的二级和三级结构。[1] 在二级结构和三级结构之间，还存在一些已被公认的过渡的结构层次。一个是超二级结构，另 一个是结构域。然而并不是每个蛋白质中都一定存在这些过渡结构层次的。一般，分子量较大的蛋 白质出现多个过渡性结构层次，特别是结构域的可能性更大。