肿瘤调控机制中如何利用公共数据——ceRNA的机制研究.PDFVIP

肿瘤调控机制中如何利用公共数据 ——ceRNA的机制研究 赵文静 GCBI服务顾问 上海其明信息技术有限公司 背景 肿瘤的发生是一个多因素参与的复杂生物学过 程，研究表明，miRNA，mRNA，假基因转录产物和 lncRNA都参与了调控肿瘤发生发展，而它们之间可能存 在复杂的网络关系；随后的研究也从生物信息学、细胞 生物学和动物模型等不同水平，证实了这一推论，即 ceRNA的调控机制。这向我们展示了基因转录后调控的 全新层面，也为理解肿瘤等疾病发生的机制提供了新的 思路。 主要内容 1. ceRNA的简介 2.ceRNA的作用机制 3.ceRNA的研究策略 ceRNA概念 ceRNA(competing endogenous RNAs ) 竞争性內源RNA：mRNA、假基因转录物和长链 非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合 相同的microRNA来调控各自的表达水平，从而影响 细胞的功能。 验证的ceRNA ceRNA网络 SPONGE MODULE 主要内容 1. ceRNA的简介 2.ceRNA的作用机制 3.ceRNA的研究策略 ceRNA作用机制 影响ceRNA竞争的因素 深灰色：激活 浅灰色：抑制 a,Steady state levels of ceRNA1(protein-coding region shown in red) and ceRNA2 (protein-coding region shown in blue). Active repression by miRNAs is shown in light grey. 影响ceRNA竞争的因素 深灰色：激活 浅灰色：抑制 b, If expression of ceRNA2 increases, this will increase expression of ceRNA1. 影响ceRNA竞争的因素 深灰色：激活 浅灰色：抑制 e, ceRNA4 contains miRNA response elements (MREs, purple and orange) for multiple shared miRNAs, and may be a more effective ceRNA than ceRNA2. f, ceRNA5 contains more MREs than ceRNA2 and may be a more effective ceRNA. 影响ceRNA竞争的因素