基于反向对接法的独脚金内酯抗炎机制分子模拟-暨南大学学报.PDFVIP

第３９卷 第１期 暨南大学学报（自然科学与医学版） Ｖｏｌ．３９　Ｎｏ．１ ２０１８年２月 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＪｉｎａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ＆ＭｅｄｉｃｉｎｅＥｄｉｔｉｏｎ） Ｆｅｂ．　２０１８ 　 基于反向对接法的独脚金内酯抗炎机制分子模拟 １ １ １ ２ １ 陈奕锐 ，　邓秋莹 ，　陈晓建 ，　汪锦才 ，　赵志雄 ， １ ２ １，２ 邝杰豪 ，　孙平华 ，　郭嘉亮 （１．佛山科学技术学院 口腔医学院，广东 佛山５２８０００；２．暨南大学 药学院，广东 广州５１０６３２） ［摘　要］　目的：利用反向对接法探索独脚金内酯 ＧＲ２４在 ＮＦＢ信号通路抗炎作用的潜在药物作用靶点． κ 方法：通过获取６２个ＮＦＢ信号通路的蛋白晶体学结构，构建ＮＦＢ信号通路蛋白靶点结构数据库；使用分子对 κ κ 接软件ＡｕｔｏＤｏｃｋＶｉｎａ，将ＧＲ２４与结构数据库中的靶点进行反向分子对接模拟实验；根据对接分数和对接构象相 互作用，筛选出潜在的药物靶点．结果：反向筛选得到３个与ＧＲ２４具有高亲和性的靶蛋白ＰＡＲＰ１、ＣＫ２和ＡＫＴ；在 对接构象的相互作用的比较中，ＰＡＲＰ１优于 ＣＫ２和ＡＫＴ；与现有 ＰＡＲＰ１抑制剂相比，ＧＲ２４有一定的相似性． 结论：独脚金内酯ＧＲ２４对ＰＡＲＰ１、ＣＫ２和ＡＫＴ靶蛋白具有竞争抑制的活性，该研究结果为独脚金内酯抗炎机制 的研究提供重要的参考依据． ［关键词］　独脚金内酯；　ＮＦＢ通路；　抗炎；　反向对接 κ ［中图分类号］　Ｒ３１８　　［文献标志码］　Ａ　　［文章编号］　１０００－９９６５（２０１８）０１－００１７－０７ ｄｏｉ：１０．１１７７８／ｊ．ｊｄｘｂ．２０１８．０１．００３ Ａｎｔｉｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｓｔｒｉｇｏｌａｃｔｏｎｅ ｂａｓｅｄｏｎｒｅｖｅｒｓｅｄｏｃｋｉｎｇｍｅｔｈｏｄ １ １ １ ２ １ ＣＨＥＮＹｉｒｕｉ，　ＤＥＮＧＱｉｕｙｉｎｇ，　ＣＨＥＮＸｉａｏｊｉａｎ，　ＷＡＮＧＪｉｎｃａｉ，　ＺＨＡＯＺｈｉｘｉｏｎｇ，　 １ ２ １，２ ＫＵＡＮＧＪｉｅｈａｏ，　ＳＵＮＰｉｎｇｈｕａ，　ＧＵＯＪｉａｌｉａｎｇ （１．ＳｃｈｏｏｌｏｆＳｔｏｍａｔｏｌｏｇｙａｎｄＭｅｄｉｃｉｎｅ，ＦｏｓｈａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｏｓｈａｎ５２８０００，Ｃｈｉｎａ； ２．ＰｈａｒｍａｃｙＣｏｌｌｅｇｅ，ＪｉｎａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０６３２，Ｃｈｉｎａ） ［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：ＴｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅａｎｔｉｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｓｔｒｉｇｏｌａｃｔｏｎｅａｎａｌｏｇｕｅＧＲ２４， ｖｉａｔｈｅａｐｐｒｏａｃｈｏｆｒｅｖｅｒｓｅｄｏｃｋｉｎｇｉｎｔｈｅＮＦＢｓｉｇｎａｌｉｎｇｐａｔｈｗａｙ．Ｍｅｔｈｏ