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计算机实习II
计算机实习II
建一个子区:my_matlab,将数据文件soil_elements.txt拷入,其为Si、Al、Ca、Mg、Cd、Pb、Cr、Ni、Fe、B的含量
运行Matlab程序,在当前路径(current directory)中选为my_matlab所在的路径。
用New M-File按纽进入程序(即M-文件)编写界面。并输入
function A=readdata(delimiter)
% A=readdata(delimiter),
% delimiter为数据分隔符,可为空格、逗号、回车符
fname=uigetfile(*.m;*.dat;*.txt,数据文件);
% 弹出文件对活框,第1个字符串为文件名过滤器,即只显示后缀为m,dat或txt的文件
% 第二个字符串为对话框标题
fid= fopen(fname,r); % 打开文件用于读取(’r’代表read), fname为路径和文件名
A = dlmread(fname,delimiter); % 读文件至数组 A
fclose(all); % 关闭文件
并在当前路径下存在为readdata.m
在命令窗口(command window)下键入
A=readdata(‘,’);
Min=min(A), Max= max(A), Sum=sum(A)
Mean=mean(A), Median=median(A),
Std=std(A)
Sk=skewness(A), K=kurtosis(A)
R=corrcoef(A)
计算数据的最小值、最大值、和、均值、中位数、标准差、偏度系数、峰度系数、相关系数矩阵。
6、在命令窗口(command window)下键入
A=readdata(‘,’);
plot(A(:,1), A(:,2),’rs’)
绘出变量SiAl的散点图。用命令
Help plot
并拷入刚才建的word文档,做图件说明。
Histogram(A(:,3),15) %绘直方图,分组数15
做其它元素的直方图。
并拷入刚才建的word文档,做图件说明。
function B=transfer(A) % 数据的极差变换
[n,p]=size(A);
Max=max(A);
Min=min(A);
for j=1:p
Maxj=Max(j);
Minj=Min(j);
for i=1:n
A(i,j)=( A(i,j)-Minj)/(Maxj-Minj);
end
end
B=A;
并在当前路径下存在为transfer.m
A=readdata(‘,’);
B=transfer(A)
观察A矩阵
9、再建一个做Q-型系统聚类法的Matlab程序(M-文件)
function my_cluster(X,metric,link,nG)
% 对原始n×p数据矩阵X作Q-型聚类分析,
% 字符串变量 metric 为选用的相似性度量,可为
% euclid or ‘eu’ —— 欧氏距离
% seuclid or ‘se’ —— Standardized Euclid metric
% cityblock or ci —— City Block metric
% mahal or ‘ma’ —— 马氏距离
% minkowski or ‘mi’ —— 明氏距离
% 字符串变量 link 为选用的系统聚类方法或称连接法,可为:
% single —— 最短距离法 (缺省)
% complete —— 最长距离法
% average —— 平均距离法
% centroid —— 重心法
% ward —— 离差平方和法
% nG为欲分的类数,nG=2
Z=zscore(X);% 变量标准化,也可改极差变换
D=pdist(Z, metric);% 距离矩阵,结果为一维向量,依次为(1,2),(1,3),..., (1,n),
% (2,3),...(2,n),.....(n-1,n)
L = linkage(D,link);%用参数linkage所指定的方法产生一个聚类谱系,L为(n-1)×3 矩阵
% 前两列为样品对的编号,原始样品即为数据阵中的行号i, ,
% 新归并的类依次记为n+1,n+2,…。L的最后一列为样品对的距离。
dendrogram(L)%绘制谱系图
T = cluster(L,nG)%将所有样品归为nG类,T依原样品顺序给出其归属的类别数,当n较大时可不必画
%出谱系图
Find(T==1)%可列出必于第一类的各样品序号
保存成 my_cluster.m
在命
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