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2018-03-07 发布于河南
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H1N1聚合酶.ppt

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H1N1聚合酶

H1N1聚合酶背景结构和活化中心反应机理猜测和构型优化一·背景 H1N1是一种病毒，它的宿主是鸟类和一些哺乳动物。有些H1N1病毒引起严重的疾病大多发生于家禽方面，而人类却很少出现。但经过鸟类和哺乳动物的传播和变异，这可能导致疫情或人类流感大面积传播。在H1N1病毒基因组上包含8个单体（非配对） RNA链代码为11蛋白(HA, NA,NP, M1, M2, NS1, NEP, PA, PB1, PB1-F2, PB2) 。总基因组大小是13588。 NA神经氨酸酶 NP核蛋白 M 基质蛋白 NS的两种截然不同的非结构蛋白（ NS1和NEP） PA RNA聚合酶 PB1 的RNA聚合酶和PB1 - F2代蛋白 PB2 RNA聚合酶二.结构和活化中心 N1N1聚合酶主要包括 PA RNA聚合酶，PB1 RNA聚合酶（PDB：2ZNL）。其中PB1起主要作用，PA起支撑辅助作用。 PB1有15个残基，其中苏氨酸THR6,赖氨酸LYS11，缬氨酸VAL12，脯氨酸PRO13为活化中心。三.反应机理猜测和构型优化方法：DFT，B3LYP，3-21G/6-31G 模型1 模型2 模型3 问题：没有原始晶体数据，如何判断优化是否正确。是否有更好的构型来进行优化？ * * * *