[生物学]microRNA Profiling presentation for 2006 Road show.pdf

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2018-03-07 发布于浙江
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[生物学]microRNA Profiling presentation for 2006 Road show

Welcome To Welcome To 使用MPSS技术使用MPSS技术进行microRNA Profiling的介绍进行microRNA Profiling的介绍宝生物工程（大连）有限公司报告内容 MPSS技术简单介绍使用MPSS进行microRNA的解析方法 miRNA研究工具的介绍 MPSS : Massively Parallel Signature Sequencing Massively Parallel Signature Sequencing 最强有力的基因表达定量解析方法之一。可以一次获得~ 100万个序列信息解析的序列长度为20nt左右通过获得的序列可以确定基因的种类通过获得序列出现的频率可以得到该基因的表达量 MPSS实施过程制备Micro-beads Library cDNA Library Micro-beads Library 读取数据 Gen III Instrument A A T G T C C G 读取数据 C G A T C G A T C 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 数据解析 17nt ~ 20nt 1M sequences 被克隆的所有DNA片段序列信息都可用MPSS方法获知 non-coding RNA AAAAAA AAAAAA GATC CAP AAAAAA 5’-prime 3’-related 使用MPSS进行microRNA的解析方法 microRNA （miRNA）・19 - 25 nt ( 21-23 nt, 18-24 nt, 20-22 nt, 20-25 nt ) ssRNA ・基因表达的调控参与细胞的发生、分化、增殖、凋亡、压力应答等的调节・与Target mRNA的3’UTR结合进行表达抑制分解target mRNA使基因转录后沉默・有Hairpin构造的前体 lin-4 : C. elegans let-7 : C. elegans miRNA的形成过程转录产物 pri-miRNA Drosha pre-miRNA