第5章_生物芯片技术.ppt

第5章 芯片技术Chapter 5 Chips Technology 5.1 概述 分类 按照芯片键合的配基分类：基因（DNA）芯片、蛋白芯片、多肽芯片、细胞芯片（药物筛选细胞芯片、细胞膜电位芯片、神经生物芯片）、组织芯片（石蜡切片芯片、肿瘤组织芯片）等。 按照芯片结构分类：微阵列（点阵）芯片（包括DNA芯片、蛋白芯片）、微流控芯片（包括过滤分离芯片、电促/电转移芯片、生化反应芯片、毛细管电泳芯片、色谱芯片、PCR芯片、质谱芯片等）、芯片实验室（微全分析系统，μTAS）。 特点与应用 生物芯片具有高通量、微型化和自动化的特点，生物芯片发展的最终目标是将从样品制备、生化反应到检测的整个分析过程集成化以获得所谓的微型全分析系统或称缩微芯片实验室。 应用领域包括：生物科学（基因组学，DNA测序），医药（药理学，高通量药物筛选，毒理学，药物基因组学，药物分析，疾病诊断，遗传病基因检测），农业、食品和环保（环境检测和防治，农作物优育和优选 ，食品卫生监督）等。 5.2 微阵列芯片 基因芯片结构示意图 蛋白质芯片结构示意图 微阵列芯片的关键技术 5.2.1 芯片载体的选择 5.2.2 芯片的制作（样品的键合或原位合成） 5.2.3 样品的键合 5.2.4 检测技术 5.2.5 高通量数据采集和处理 5.2.1 芯片载体的选择 载体的要求：活性基团、稳定、生物相容性） 材料：无机、天然有机聚合物、合成高分子、高聚物制作的膜，常见的有玻璃、金属片、高分子片/膜 载体的活化（样品键合） 5.2.2 芯片的制作 5.2.3 样品的键合 5.2.4 检测技术 紫外 荧光 电化学 质谱（如MALDI-TOF、ESI、SEIDI） 同位素， 化学发光 表面等离子体共振（成像）检测（SPR） 非接触AFM 免疫测定 （激光）拉曼光谱 ICP-MS 表面等离子体共振（surface plasma resonance SPR） 原子力显微镜（AFM） 5.2.5 高通量数据采集和处理 图像分析与处理 图像校正 平滑/滤波 去除污点 样斑识别 背景的确定 图像比较、扣除 绘图/显示界面 数据分析与处理 数据保存 数据归一化及相关统计分析（聚类分析、主成分分析、时间系列分析、曲线拟合、误差估计 数据校正 相应的计算 结果的显示（绘图） 数据库及网络资源搜索 信息管理系统 基因表达水平的检测 药物筛选 基因诊断 5.3 微流控芯片 微流控芯片以微通道网络及众多分析功能元件的集成化为特征，微阵列芯片则以高密度的微探针为特征。 5.3.1芯片材料： 硅 石英，玻璃 硬质高分子聚合物（聚碳酸脂PC、聚甲基丙烯酸甲酯PMMA、聚对苯二甲酸乙二醇酯PET等） 弹性聚合物（聚二甲基硅氧烷PDMS） 光敏聚合物（SU-8） 其它（聚酰亚胺、金属等） 5.3.2 芯片加工技术 光刻： 掩膜制备,光刻胶（负光胶（SU-8）、正光胶） 曝光和显影（200～400nm的紫外线） 刻蚀 分为物理刻蚀和化学刻蚀（干法和湿法），主要用于硅、石英（玻璃）等基质 湿法刻蚀中常见的刻蚀剂： 硅基质：HNA（HF+HNO3+HAc）、强碱（NaOH、KOH等） 玻璃基质：HF+NH4F 干法刻蚀：等离子体刻蚀和深度反应离子刻蚀（利用射频激发） 聚合物芯片的加工： 聚合物芯片上的微结构是通过模具转移的，加工方法有： 注塑法、原位聚合法、热压法、激光刻蚀法 5.3.3 微流控元件的 微流控元件包括：微阀、微泵、微混合器、微分离器、微热交换器、微反应室等等。 微型阀： 有源阀：静电微阀、压电微阀、形状记忆合金（SMA）微阀、电磁微阀、气动微阀、热气动微阀、无活动部件的微阀 无源阀（被动阀）：常用作单向阀－往复式微泵 微反应器： 微化学反应器 聚合酶链（PCR）微反应器 生化微反应器（包括酶微反应器、免疫微反应器、DNA杂交微反应器等，其固定载体有：微通道壁、微球、硅胶－凝胶、薄膜、水凝胶、整体柱） 5.3.4 微流控芯片检测系统 对检测系统的要求：高灵敏度、好的信噪比、快的相应速度、方便与芯片连接、集成性好、稳定性高、体积小、成本低、具有并行检测功能等。 按检测原理可分为：光学检测（吸收光谱检测、荧光检测、化学发光检测）、电化学检测、质谱检测等。 5.3.5 微流控芯片的应用 微流控芯片在生物医学领域的应用 聚合酶链反应（PCR） 核酸分析 基因突变检测 蛋白质分析 细胞计数和分类筛选 单细胞分析 5.3.6 生物芯片技术的发展 生物芯片技术是一门综合性的技术，涉及生物、医学、材料学、(微)加工、制造、微流体力学、电子学、仪器分析化学、传感器学、有机合成化学、电化学、 光学、信号采