分子生物学第1章.ppt

但由于?-碳原子与其他原子之间均形成单键，因此两相邻的平面结构可以作相对旋转。其旋转角分别为φ和ψ，可描述多肽链的所有可能构象。 (1)蛋白质的二级(Secondary structure)结构 指肽链主链的折叠和盘绕方式。它只涉及肽 链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 （1）α-helix(螺旋) （2）β-sheet(折迭) （3） β-turn(转角/U形转折/回折) （4）random coil(无规卷曲) Exercises How many physical interactions are there involved in protein folding? Please describe the three-dimensional structures of proteins. The carboxyl group of one amino acid can react with the amino group of another amino acid to form a peptide bond. Because all amino acids have these two groups, any amino acid can join to any other amino acid. Proteins can be composed of any combination of the twenty amino acids, in any number and in any order. 一个氨基酸上的氨基可以与另一个氨基酸上的羧基发生反应形成肽键。由于所有氨基酸都具有这两个基团，因此任何氨基酸都可以与任何其它氨基酸相连接。蛋白质可以由20种氨基酸以任何组合、任何数目和任何顺序组成。 两个氨基酸缩合形成2肽 dehydration [7di:hai5dreiFEn] n. 脱水 肽键（peptide bond） ：氨基酸的—NH2与另一个氨基酸的—COOH脱水缩合而成的键。又称酰胺键。 The peptide bond has a partial double-bond character. This is because the double-bond joining the carbon and oxygen is also distributed between the same carbon and the adjacent nitrogen. This means that the peptide bond exists as an intermediate between a single bond and double bond. 肽键具有部分双键的特性，这是因为连接碳和氧的双键也在同一个碳和邻近的氮之间进行分配。这就意味着：肽键是以单键和双键的中间形式存在的。 Because the peptide bond has the partial double-bond character, it is rigid and cannot rotate easily. But other bonds can rotate quite freely. So the amino acid chains are flexible. Actually, protein molecules bend, fold, and twist to form complicated three-dimensional structures. 由于肽键具有部分双键的特性，所以它是僵硬的、不容易发生旋转的。但是，其它键却是容易发生旋转的，因此，氨基酸链还是容易弯曲的。实际上，蛋白质分子会发生弯曲、折叠和扭曲从而形成复杂的三维结构。 psai 普西 存在着氨基酸组成和排列相同，但空间结构不同的蛋白质 The ends of a protein chain are different. On one end, there is an amino group. This end is called the N-terminus. On the other end, there is a carboxyl group. And it is called the C-terminus. 蛋白质链的两个末端是不同的。在一个末端上保留了一个氨基，这个末端叫做N-末端。在另一个末端上有一个羧基，这个末端叫做C-末端 氨基端到羧基端的方向 在多肽链中的氨基酸，由于其部分基团参与了肽键的形成，剩余的结构部分则称氨基酸残基 We have said that the flexibil