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2018-03-21 发布于天津
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Blood Pressure Phenotypes 27 blood pressure phenotypes Baseline Blood Pressure Maximal Response MAP, DBP, SBP, PP MAP, DBP, SBP, PP after salt-load Drug Challenges Delta BPs Linkage Analysis for Blood Pressure QTLs Genome scans in 7 intercrosses representing independent model for genetic hypertension 200-300 SSLP markers 10-20 cM spacing 57- 390 animals Linkage analysis using MAPMAKER/QTL computer package LOD score 2.8 suggestive LOD score 4.3 significant QTL #1 QTL #2 QTL #3 QTL cluster Drop of 1.6 LOD units = 95% confidence interval Analysis of QTL Clustering QTLs identified in Rat LOD score 4.3 13 LOD score 2.8-4.3 44 LOD score 2.5-2.8 11 68 blood pressure QTLs total 13 QTL clusters total 7 QTL clusters 2 or more crosses 6 QTL clusters within one cross 10 single QTLs Baseline BP 2 Max. response 7 MAP, DBP, SBP, PP 19 Salt MAP, DBP, SBP, PP 22 Drug challenge 7 Delta BP 11 Human chromosome 22 and its homologies to rat chromosomes 11, 20, 6, 14 and 7 VC-MAP : Bioinformatics-‘Tool‘ for comparative maps Stoll et al., Genome Research 2000 Kwitek et al. Genome Research 2001 36 syntenic regions in human Coverage of human genome in cM: ~800 cM (~24%) 68 rat blood pressure QTLs = 13 QTL clusters and 10 single QTLs Coverage of rat genome in cM: 500 cM (31%) Comparative mapping Stoll et al., Genome Research 2000 Chr.1 Chr.2 51,52,53,54 30,31,32,33,38 34,35,36,37 45,46,47,48 13,14,15,16 17,18,19 20,21,22,23, 24,25,26 Mansfield et al. Krushkal et al. 39,40,41,42 20,21,22,23, 24,25,26 51,52,53,54 27,28,29 13,14,15,16 17,18,19 Chr.3 Chr.4 Predicted hypertension susceptibility loci in the human genome Stoll et al., Genome Res. 2000 Mouse Rat Family Blood Pressure Program (FBPP)1995-2000:12,041 subjects genotyped GenNet GENOA HyperGEN SAPPHIRe FBPP 4 networks # subjects # families African American Maywood, IL 816 289 Non-Hispanic White Tecumseh, MI 1,010 303 8 BP-related linkage peaks with max. lod score 2 Comparative Genomics: Convergence of Ge