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G03W 的安装、初始化和作业启动 Gaussian 03 for Windows Tutorial-1 G03 的主要计算功能 G03 的程序结构 G03W的功能和程序结构 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03的基本模块和功能 读入并处理Route Section 读入分子特性参数 确定分子对称性（点群和阿贝尔子群） 设定和配置基集，计算单电子积分 产生MO的初始猜测 叠代解 SCF 方程 指认MO对称性, 打印MO波函数并进行 Mulliken 布居分析 结束作业 G03W软件的安装和运行环境设定 G03W 的安装 G03W 根目录下的文件和子目录 定制缺省的许用内存和硬盘空间 在子目录\Scratch下创建Default.Rou文件对缺省值进行设定 编制Default.Rou文件的实例 打开Default.r3文件并进行修改 G03W程序界面和工具栏 G03W用户界面 用户界面的条形工具栏 File 下拉菜单的命令 在Process拉菜单的命令 Utilities下拉菜单的命令 程序的初始化设置 主窗口显示格式的初始化设置 主窗口用不同字体输出的显示比较 G03W的输入 G03W作业的命令和目标分子的荷电、自旋特性及原子坐标等初始数据可择以下三种方式之一输入 G03输入文件的格式 输入文件*.gjf的实例 在Job Entry图形界面上直接输入 在Job Entry图形界面上直接输入 Route Section栏的作业指令的“语法”检查 在外部ASCII文本编辑器上编辑输入文件 在Chem3D界面上创建 *.gjf 文件 在GaussView界面上创建 *.gjf 文件 分子说明段中的坐标选择 分子内坐标的定义 内坐标实例 ━ H2O2分子 “右手定则”浅释 在内坐标阵列中引入变量符号 引入内坐标变量实例 1 ─ CH4分子 引入内坐标变量实例 2 ─ 苯分子 准备G03W输入文件的一般流程 从准备输入文件到运行G03W 可用Windows“记事本”或“写字板”编辑，但强烈推荐用EditPlus 3.12 EditPlus有什么优点？ ⑴ 浏览、编辑文本文件的大小无限制 ⑵ 可进行文本的“列拷贝和删除”以及“长方块的拷贝和删除” NotePad WritePad EditPlus 在“Calculations”下拉菜单上点击“Gaussian Interface” 选项： 在“Calculations”下拉菜单上点击“Gaussian Interface” 选项： 填写完毕后点“ Edit ”按钮保存 *.gjf 文件并打开并打开文本编辑器修改 分子中各个原子核的相对位置可采用笛卡尔坐标、分子内坐标 (即Z-matrix) ，或二者的混合来表示 笛卡尔坐标下每个原子的输入行为 4 列: 内坐标下每个原子的相对坐标需借助 1~3 个“参考原子” 来定义。每个输入行为 7 列： 以参考原子的序列号表示 0~180? -180~180?，用右手规则确定 H2O2具有右旋(a)和左旋(b)两种互为镜像的异构体: 当前原子A 参考原子1 参考原子2 参考原子3 O(2) O(3) H(1) H(4) (b) O(2) O(3) H(1) H(4) (a) 在“标准构型参数”近似下，两种分子的原子内坐标分别为: 序列号≥4 的原子均需定义两面角，其取值范围为?180?，正负号由“右手定则”确定。即：右旋为两面角的正方向（详见下一页面） ? 右手定则 基准面 取包含 3 个参考原子的平面为基准面、参考原子 2 指向原子 1 的位矢方向为基转轴的正方向 基转轴正方向 若被定义的原子A与参考原子 1、2 构成的平面位于基准面的逆时针方位，则其二面角参量为正号，否则为负号 参2 参1 参3 H(4) (a) (b) 参2 参1 参3 H(4) 基准面 根据这一规则，原子H(4)的二面角参量在构型a中为+120o；在构型b中则为-120o 分子的几何全优化需对全部3N-6个内坐标进行优化计算。当分子具有二阶或二阶以上的点群对称性时，可将对称等价的键长、键角或两面角用同一变量（英文字母）表示，随后统一赋予初值 例如H2O2分子 (C2v对称性) 有相等的键长、键角各一对。Z-matrix可改为 原子内坐标输入结束加一空行后为变量赋初值段。标注“Variables:”仅仅是为阅读文件的方便 故 “Variables:”的标注可省略。如欲加之则须保证拼写和标点正确无误 或 对于属 Td 或 Oh 群的高对称性分子，坐标变量用于笛卡儿坐标通常也是方便有利的。例如CH4分子 (T