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6丙酮酸经由PDH复合体氧化脱羧成乙醯辅酶A
p.674 圖 16-16 (續) p.674 圖 16-16 (續) p.674 圖 16-16 (續) 機轉圖16-16 丙酮酸羧化酶催化反應中生物素的角色。生物素透過醯胺鍵與酵素一個離胺酸殘基的 ε-胺基結合,形成生物素醯-酵素。受生物素媒介的羧化反應以兩階段形式進行,一般受酵素上分別於兩不同位置的活性區所催化,以丙酮酸羧化酶反應為例。在第一階段(步驟 至 ),重碳酸鹽被轉化為較具活性的二氧化碳,再將生物素羧化。生物素作為一個攜帶者在四元體上將二氧化碳由一活性區傳遞至另一相鄰單體的活性區(步驟 )。反應的第二階段(步驟 至 ),在第二活性區催化,二氧化碳與丙酮酸反應形成草醯乙酸。 p.675 圖 16-17 圖16-17 生物學上的栓鏈。輔因子硫辛酸、生物素以及結合 β-巰基乙胺與 A 酸形成一長且可彎曲的長臂(藍色)與酵素產生共價鍵結,當作栓鏈將中間產物由一個活化區轉移至另一處。圖中每個粉紅著色區域為活化的中間產物與栓鏈的結合處。 總結 16.2 檸檬酸循環(克式循環、TCA 循環)可說是一個幾乎萬能的分解代謝路徑中心,其可將醣類、脂肪以及蛋白質分解後的成分進一步氧化成二氧化碳,並且暫時將氧化作用的能量儲存於電子載體 FADH2 及 NADH之中。在有氧代謝作用時,這些電子會轉移給氧分子而電子流的能量最終會以 ATP 的形式貯存。 乙醯輔酶 A 進入檸檬酸循環(在真核細胞的粒線體和細菌的細胞質中),經檸檬酸合成酶催化與草醯乙酸的縮合反應而形成檸檬酸。 p.675 總結 16.2(續) 在七個連續反應中,包含兩個脫羧化反應,檸檬酸循環將檸檬酸轉化成草醯乙酸並且釋出兩個二氧化碳分子。此途徑是循環式的,以確保此中間產物不會被用完;因此當一個草醯乙酸在路徑中被消耗時,有另一個草醯乙酸會生成。 每一個乙醯輔酶 A 經檸檬酸循環氧化後,其能量獲得包含三個 NADH 分子、一個 FADH2 分子以及一個核三磷酸(ATP 或 GTP)。 p.675 總結 16.2(續) 除了乙醯輔酶 A 之外,任何能產生檸檬酸循環中四碳或五碳中間產物的化合物—譬如,許多胺基酸分解後的產物—也可以被此循環所氧化。 檸檬酸循環為兩用代謝途徑,作用於分解以及合成作用;循環的中間產物可以挪走並且當作許多生物合成產物的起始物質。 p.675 總結 16.2(續) 當中間產物從檸檬酸循環中移除去進行其他路徑時,它們會再經由數個補給反應重新補給,例如:四碳中間產物可由三碳物質經羧化生成;這些反應由丙酮酸羧化酶、PEP 羧激酶、PEP 羧化酶以及蘋果酸酵素催化。催化羧化反應的酵素通常利用生物素活化二氧化碳並將之攜帶到接受者,例如:丙酮酸或磷酸烯醇丙酮酸。 p.675 16.3 檸檬酸循環的調節 p.675 由丙酮酸去氫酶複合體生成的乙醯輔酶 A 由變構異位機制及共價機制所調節 哺乳動物的 PDH 複合體受到 ATP 和乙醯輔酶 A 以及 NADH,即複合體催化反應產物的強烈抑制(圖 16-18)。 p.676 圖 16-18 p.676 圖 16-18 (續) 圖16-18 從 PDH 複合體到流經檸檬酸循環過程中代謝流量之調節。PDH 複合體在 [ATP] / [ADP]、[NADH] / [NAD+] 和 [乙醯-CoA] / [CoA] 的比值高時,會受變構性抑制,顯示其正處於一能量足夠之代謝狀態。當這些比值降低時,丙酮酸受變構性活化而氧化。檸檬酸循環的流量速率會受到檸檬酸合成酶的受質、草醯乙酸和乙醯輔酶 A 或 NAD+ 之利用率所限制,或是如 NAD+,其可能因為轉變成 NADH 而流失,如此會使得三個依賴 NAD 的氧化步驟變得緩慢。琥珀醯輔酶 A、檸檬酸和 ATP 的回饋性抑制亦可使前幾個步驟受抑制而減緩檸檬酸循環。在肌肉組織中,鈣離子能傳遞收縮訊息,在此圖中,也顯示了鈣離子能夠刺激能量產生的代謝活動,以補償經由收縮而消耗的 ATP。 p.676 檸檬酸循環在其三個放能步驟中受調控 下列三個因素決定了循環的流動速率:受質的利用率、產物累積後的抑制作用以及催化循環前幾個步驟的酵素所受到的異位性回饋抑制。 此循環的三個強烈放能步驟中的每一個步驟——受檸檬酸合成酶、異檸檬酸去氫酶以及 α-酮戊二酸去氫酶所催化。 p.677 經由多酵素複合體的受質引導可發生於檸檬酸循環 雖然我們通常以粒線體基質中的可溶性成分來敘述檸檬酸循環的酵素,但愈來愈多的證據顯示在粒線體中,這些酵素是以多酵素複合體的方式存在。 當細胞被打破開來,其內含物包括酵素即會受到 100 或 1,000 倍的稀釋(圖 16-19)。 p.677 圖 16-3
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