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生物信息学教学大纲-浙江大学宁波理工学院教务部.pdf

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生物信息学教学大纲-浙江大学宁波理工学院教务部

《生物信息学》教学大纲 (一)课程基本信息 1. 课程代码 2. 课程名称(中文/英文):《生物信息学》(Bioinformatics) 3. 课程类别:专业主修课 4. 课程学分:2 学分 5. 课程学时:40 学时 (其中,授课学时:24 学时;实践环节学时:16 学时) 6. 开课单位:生物与化学工程学院 7. 教学对象:生物技术、生物工程高年级学生 (二)课程简介 《生物信息学》是现代生命科学与计算机科学、信息学、统计学等相互交叉而形成的一 门新兴的最具活力的应用型学科。为生物类专业的主修课程,使学生掌握利用因特网上的各 种数据库和分析工具解释常规生物学研究难以揭示的生命活动现象的基本理论和方法。先修 课程为生物化学、分子生物学、计算机和网络技术等。 (三)课程教学目标和能力要求 通过该课程的学习,让学生熟悉本学科的基本研究思路,并掌握一些常用工具和研究方 法,以提高学生的科研和实践能力。培养学生跨越学科、领域的大科学素质和意识,提高 学生的综合素质,提高学生在本领域内的发展潜力,也为今后选择新兴交叉学科领域进行深 造奠定基础。 (四)课程教学方法 本课程注重学科交叉、融合,以介绍思想、方法为主,深入浅出,避免繁琐、抽象的数 学形式,启发学生综合运用各学科知识的能力。因此,在教学方法上采取利用多媒体进行课 堂讲授为主,辅以上机实验、课题研究、分析报告、习题、实例教学、教学辅助材料等,以 加强学生对理论知识的消化和理解,在教学过程应注意积极启发学生的思维,培养学生发现 问题和解决问题的能力。 (五)课程内容及教学安排 教学主题 1: 绪论 ( 2 学时) [知 识 点] :1. 生物信息学的定义、基本概念及其发展状况;2. 生物信息学研究的基 本内容、基本原理与研究方法;3. 生物信息学的主要意义和展望,以及与生物实验的关系。 [重 点]:生物信息学研究的基本内容、基本原理与研究方法 [难 点]:正确理解和把握生物信息学的学科交叉性 [能力要求]:了解该课程在自身专业技能体系中的作用 [实践环节] :无 [教学方法]:多媒体教学 [课前阅读]:查阅生物信息学的实践应用情况 [课后作业]:结合对课程的初步学习思考生物信息学的学习方法 教学主题 2 : 生物信息数据库及其信息检索 ( 8 学时) 1 / 4 [知 识 点]:1. 生物信息数据库的主要类型,及主要生物信息数据库的组织结构和功能; 2. 利用生物数据库进行信息检索;3. 向数据库提交数据。 [重 点]:利用生物数据库进行信息检索 [难 点]:生物信息学数据库的种类及其科学运用 [能力要求]:掌握生物信息数据库的利用方法 [实践环节] :常用生物信息学数据库的应用 [教学方法]:多媒体教学、上机实验 [课前阅读]:了解目前主要的生物信息数据库 [课后作业]:利用生物信息数据库查找目的序列的相关信息 教学主题 3 : 序列比对与分子进化 ( 6 学时) [知 识 点]:1. 序列两两比对、多序列比对;2. 分子进化树简介及其建立方法与分析; 3.系统发育软件的使用。 [重 点]:序列比对和分子进化树建立方法与分析 [难 点]:序列比对的原理 [能力要求]:掌握序列比对的技术方法 [实践环节] :核酸和蛋白质序列的进化分析 [教学方法]:多媒体教学、上机实验 [课前阅读]:了解序列比对的应用情况 [课后作业]:运用软件进行目的序列的两两比对 教学主题 4 :核酸序列分析 ( 6 学时) [知 识 点]:1. 基因结构及其 DNA 序列分析的意义;2. 序列翻译与开放阅读框(ORF ) 预测;3. 核酸序列分析框架;4.

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