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- 2018-04-07 发布于北京
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1001-7445(2011)05-0764-06
基于最短路径的关键蛋白质识别研究
嘉泽宁 杨 贵 郑文萍
山西大学智能信息处理研究所,山西太原030006
摘要:关键蛋白质的识别有助于从系统水平上理解生命活动过程,基于蛋白质相互作用网络拓扑特征的关键
蛋白质识别可以有效地提高识别精度和速度。通过蛋白质节点的最短路径数和点介数可以作为衡量其节点
中心度的方法,但计算速度和计算规模有限。根据所预测蛋白质相互作用网络的特点,提出了基于最短路径
技术的关键蛋白质识别方法,选择合理的识别阈值和拓扑参数,对全蛋白质相互作用网络的关键蛋白质进行
预测。实验表明,所提出的识别方法可以有效描述蛋白质节点的重要性,在不影响计算精度的前提下,可对连
通性好,边密度大的全蛋白质相互作用网络进行关键蛋白质识别。
蛋白质相互作用网络;最短路径;关键蛋白质;介数
TP391 A
Shortestpath-basedidentificationofessentialproteins
JIAZe-ning YANGGuiZHENGWen-ping
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