生物化学课件——第1章节蛋白质.pptVIP

5. 影响二级结构形成的因素 # 蛋白质的二级结构是根据其一级结构的特点而决定的, 但在同一个蛋白质多肽链中的不同区域,可形成不同的二级结构。 蛋白质二级结构是以一级结构为基础的 影响二级结构形成的因素主要为残基侧链的大小、电荷 脯氨酸的存在影响α-螺旋的形成 分子伴侣(chaperon) 1. 概念 是指一条多肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，亦即肽链上所有原子或基团的空间排布。 2. 结构域与三级结构 结构域是指二级结构折叠比较紧密的区域，每个结构域都有自己独立的功能。 结构域通常是蛋白质的活性区域 3. 三级结构的维系力——次级键 包括疏水作用、离子键(盐键)、氢键及Van der Waals力等 三、蛋白质的三级结构 (tertiary structure) Model of myoglobin at high resolution Diagram of binding domain of fibronectin Alpha-carbon diagram of α-chymotrypsin Model of ribonuclease S 1. 概念 由两条或多条的肽链之间相互作用，彼此以非共价键相连而成的更复杂的空间排布。 2. 组成单位: 亚基 (subunit) 数量: 2～几千个 2～10, 寡聚体 10, 多聚体 亚基有自己独立的一、二、三级结构，但无完整的功能 亚基可以相同——均一四级结构 亚基亦可不相同——非均一四级结构 四、蛋白质的四级结构 (quaternary structure) 3. 主要维系力：疏水作用 Summary 第三节. 蛋白质结构与功能的关系 Section 3. Relationships between structure and functions of protein 一、蛋白质一级结构与功能的关系 (primary structure function) 一级结构一旦确定，就决定了其空间结构的排布 但一级结构并不是决定空间结构的唯一因素 (一). 一级结构是空间结构的基础 (二). 一级结构与功能的关系 1.不同的一级结构决定不同的生理功能 2. 一级结构中只有少数氨基酸残基与功能直接相关, 即功能基团, 或称关键部位(key - part) 3. 非功能基团对维持功能基团的构象有重要作用 关键部位相同，则功能可能相同或相似。如Insulin,Cyt c 关键部位不同，即便是一个氨基酸残基的改变，也可导致功能的完全改变或丧失. 如镰刀型血红蛋白 镰刀形血红蛋白 镰刀形红细胞贫血（sickle cell anemia） Differences in amino acids sequence of insulin from human and animals. Insulin A8 A9 A10 B30 human Thr Ser Ile Thr pig Thr Ser Ile Ala dog Thr Ser Ile Ala rabbit Thr Ser Ile Ser cow Ala Ser Val Ala goat Ala Gly Val Ala horse Thr Gly Ile Ala 二、蛋白质空间结构与功能的关系 (conformation function) (一). 肌红蛋白与血红蛋白的结构,Mb储存氧气Hb运输氧气 蛋白质的空间结构与生理功能密切相关 以肌红蛋白和血红蛋白为例 含153个氨基酸残基的单链蛋白和一个血红素(heme)辅基 空间结构上主要为8段α-螺旋折叠为球状, heme位于分子内部的袋形空穴中 1. 肌红蛋白(myoglobin, Mb) 由4个亚基组成，分别为2个α-亚基和2个β-亚基 每个亚