【精品资料最新版】生物化学课件 生物化学复习资料 第一章 蛋白质的结构与功能.ppt

蛋白质的结构与功能 Peptide 肽 Peptide 肽 Peptides (made of different AAs) have different isoforms Gly-Ala, Ala-Gly Gly-Ala-Lys, Gly-Lys-Ala, Ala-Gly-Lys, Ala-Lys-Gly, Lys-Ala-Gly, Lys-Gly-Ala, (1 x 2 x 3 x 4 x 5……… x n) （二） 重要生物活性肽 1. 谷胱甘肽 (glutathione, GSH) (二) ?-螺旋 α-helix α－螺旋结构 多肽链的主链围绕中心轴有规律的螺旋式上升,螺旋走向为顺时钟,即右手螺旋; 氨基酸侧链(R)伸向螺旋外侧。每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距为0.54nm; 每个肽键的N－H和其氨基端第四个肽键的羰基氧(O=C)形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴基本平行。肽链中的全部肽键都可形成氢键,以稳固α－螺旋结构。 肌红蛋白和血红蛋白分子中有许多肽链段落呈α-螺旋结构。毛发的角蛋白、肌肉的肌球蛋白以及血凝块中的纤维蛋白,它们的多肽链几乎全长都卷曲成α－螺旋。 双性α－螺旋 β-折叠 两条以上多肽链构成，多肽链充分伸展,每个肽单元以Cα为旋转点,依次折叠如扇面状； 氨基酸残基侧链(R)交替位于折叠片层上下方；平行肽链走向有平行与反平行两种方式。 通过肽链间的肽键羰基氧(O=C)和亚氨基氢形成氢键从而稳固β－折叠结构。 蚕丝蛋白几乎都是β－折叠结构,许多蛋白质既有α-螺旋又有β－折叠。 Motif (模体) (三) 氨基酸序列提供重要的生物进化信息 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合， Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数（称百分饱和度）随O2浓度变化而改变。 Mb: high affinity for O2 -- a simple hyperbolic curve(直角双曲线) Hb: low affinity for O2 -- sigmoid (S-shaped) curve(S形曲线) 朊病毒（Prion):不含核酸，完全由蛋白质构成的病毒。 最初推测朊病毒是像普通病毒一样的微粒，只是缺乏核酸。但是实际与预期的相反，朊病毒很快被证明可由细胞自身染色体的基因编码。这个基因称为PRNP，该基因位于人第20号染色体的短臂，小鼠第2号染色体。它可以表达于正常的脑组织并且编码一种命名为PrPc的蛋白质，存在于神经细胞的表面，对蛋白酶和高温敏感。PrPc精确的功能至今仍不清楚。但是这种蛋白质的变异形式目前在人脑中发现，这就是CJD。 PrPc与 PrPSc的比较 Proteomics 蛋白质组学 Key terms Peptide unit (肽单元) Motif (模体) Domain (结构域) Denaturation of protein (蛋白质变性) Isoelectric point (pI) of protein (蛋白质等电点) Isoelectric focusing （IEF） Two-dimensional electrophoresis 蛋白质组学研究的重要技术之一 生物学问题的提出 实验模型的设计 实验组和对照组样品的制备 蛋白样品的IEF和PAGE电泳分离 图像扫描和初步分析 感兴趣蛋白点的切取 胰酶对蛋白质的消化 质谱的多肽指纹图分析 质谱结果的生物信息学分析和比对 蛋白质的鉴定 其它实验的进一步验证 蛋白质组学流程图 蛋白质样品的色谱分离 Hb and O2-binding mechanism Mb Hb + + O2 O2 MbO2 HbO2 O2-saturation [HbO2] [Hb] X 100% O2-saturation curve of Mb and Hb 肌红蛋白(Mb)和血红蛋白(Hb)的氧解离曲线 How is the sigmoidal curve of Hb formed? Tense state (T state): 8 salt bonds 4 subunits tightly bound, affinity of each subunit to O2 is lower How is the S-shape curve of Hb formed? O2-Hb differs markedly in its quaternary structure from deoxy