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03分子对接docking
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Structural base drug Design:
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Molecular Docking
• 第二级
• 第三级
吕炜
• 第四级
• 第五级 创腾科技公司
计算机辅助药物设计方法分类
• 基于配体的药物设计策略
-- QSAR
-- 药效团
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• 基于受体的药物设计策略
-- 分子对接
-- 全新药物设计
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-- 分子动力学
Structure-Based Drug Design
• SBDD:计算机辅助药物设计中最庞大最活跃的研究领域
• SBDD:本质是正确评价靶标与配体之间的相互作用
• SBDD工具: 分子对接
• SBDD应用
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– 高通量虚拟筛选
– 化合物优化
– 机理研究
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什么是分子对接?
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分子对接能用来干什么?
1.研究配体-受体复合物的结
合模式
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2. 预测受体-配体的结合能力
3. 指导先导化合物的合成改
造和优化
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4. 寻找和发现新的先导化合
物
MM-PBSA Scoring应用于Chk1抑制剂正确结合模式的发现
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ΔΔG= 10.7 Kcal/mol (ε=2) ΔΔG=1.4 Kcal/mol (ε=2)
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Database(~528439)
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inhibitor was
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4425 were ordered (~1%) Active
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3169 were tested
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Active molecule from
Active molecule from
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HTS
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