黄河口八种贝类的遗传多样性分析-农业推广专业论文 word格式.docxVIP

黄河口八种贝类的遗传多样性研究摘要本文以黄河口文蛤（Meretrixmeretrix）、青蛤（Cyclinasinensis）、光滑河蓝蛤（Potamocorbulalaevis）、饼干镜蛤（Dosiniabiscocta）、中国蛤蜊（Mactra chinensis）、四角蛤蜊（Mactraveneriformis）、菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）和紫贻贝（Mytilusgalloprovincialis）八种贝类为研究对象，通过分析这八种贝类群体线粒体DNA16SrRNA和COI序列，对各种类的遗传多样性进行研究与评价。结果显示：16SrRNA和COI序列的A+T含量明显高于C+G含量，八种贝类的碱基组成偏向性明显，除青蛤16S rRNA序列外，其余种类的COI 序列及16S rRNA序列均呈现反C偏倚；16S rRNA的变异位点明显少于COI 序列，且有4 种贝类的多个16S rRNA序列共享一个单倍型，表明八种贝类线粒体DNA中，16S rRNA 基因的进化速率慢于COI 基因，16S rRNA序列更加保守；基于COI计算的遗传多样性指数中，单倍型多样度范围介于0.6381± 0.1288～0.9457±0.0313之间，由大到小依次为：四角蛤蜊＞菲律宾蛤仔＞光滑河蓝蛤＞文蛤＞紫贻贝＞中国蛤蜊＞青蛤＞饼干镜蛤，核苷酸多样度范围介于0.0016±0.001008～0.0185±0.0098之间，由大到小依次为：紫贻贝＞光滑河蓝蛤＞菲律宾蛤仔＞四角蛤蜊＞中国蛤蜊＞文蛤＞青蛤＞饼干镜蛤，两两平均核苷酸差异数范围介于0.7619±0.5913～12.1988±5.7682 之间，由大到小依次为：紫贻贝＞光滑河蓝蛤＞菲律宾蛤仔＞四角蛤蜊＞中国蛤蜊＞文蛤＞青蛤＞饼干镜蛤。这表明，相对紫贻贝和四角蛤蜊而言，其余贝类的遗传多样性均偏低；基于COI序列计算的遗传距离显示，所有贝类的种内遗传距离较小；基于COI序列分别构建这八种贝类群体内的邻接关系树显示，所有贝类种内没有检测到显著的谱系结构，各分支支持率较低。关键词：黄河口；文蛤；青蛤；光滑河蓝蛤；饼干镜蛤；中国蛤蜊；四角蛤蜊；菲律宾蛤仔；紫贻贝；线粒体DNA；16SrRNA；COI；遗传多样性Genetic Diversity of Eight Shellfish Species from TheYellowRiverEstuaryAbstractInthisstudy,eightshellfishspecies(Meretrixmeretrix,Cyclinasinensis, Potamocorbulalaevis,Dosiniabiscocta,Mactrachinensis,Mactraveneriformis, Ruditapesphilippinarum,Mytilusgalloprovincialis)fromtheYellowRiverEstuarywerecollected,andthegeneticdiversityofthemwasstudiedandevaluatedrespectivelybasedon16SrRNAandCOIsequencesofmitochondrialDNA.Theresultsdemonstratedthatbasecompositionbiaswassignificantin16SrRNAandCOI sequencesoftheeightshellfishspeciesasA+TcontentwashigherthanC+Gcontent.Furthermore,allthesequencesof16SrRNAandCOIpresentedanti-Cbiasexcept16SrRNAsequencesofC.sinensis.Polymorphicsitesof16SrRNAsequencesweresignificantlylessthanCOIsequences,andthe16SrRNAsequencesoffourshellfishspeciessharedonehaplotyperespectively,indicatingthatevolutionaryrateof16S rRNAgeneisslowerthanCOIgene.ThegeneticdiversityindexeswerecaculatedbasedonCOIgene,genediversityvaluesrangedfrom0.6381±0.1288to0.9457±0.0313,M.veneriformisR.philippinarumP.laevisM.meretrixM. galloprovincialisM.ch