深圳美德医疗功能磁共振图像处理软件使用手册1软件安装与运行.DOCVIP

深圳美德医疗功能磁共振图像处理软件使用手册 1、软件安装与运行 双击fMRIAnalyze安装文件“fMRIAnalyze-0.15.1-win64”， 图1 fMRIAnalyze软件安装向导 点击下一步后进入许可证协议页面， 图2 fMRIAnalyze许可证协议 选择“我接受”，设置安装选项， 图3 fMRIAnalyze安装选项设置 采用默认设置，点击下一步， 图4 fMRIAnalyze设置安装位置 设置软件的安装目录后，点击下一步，设置“开始菜单”文件夹，用户可以自己设置文件夹名称。这里采用默认名字，如图5，点击安装，进入安装进程。 图5 设置“开始菜单”文件夹名称 图6 软件安装中 安装完成后，点击完成即可。 图7 软件安装完成 安装完成后，点击系统“开始”菜单，选择“所有程序”，找到“fMRIAnalyze 0.15.1”程序文件夹，打开“MITK - ExtApp Application”程序，进入fMRIAnalyze软件运行界面。或者打开安装目录下bin文件夹，双击ExtApp也可运行程序。程序界面如下： 图7 fMRIAnalyze软件运行界面 2、磁共振功能图像统计 2.1、读取磁共振功能图像 1）为了正常读入图像，将“dicom.txt”、“excite.txt”、“HeaderInformation.txt”、“numaris.txt”、“philips_mr.txt”五个文件拷贝至安装目录bin文件夹内。否则，图像读取异常，提示读取“header”文件失败。 图8 读取图像失败 2）读取图像。点击菜单“文件”，如下图所示，点击“打开FMRI系列”，打开“功能磁共振图像序列读取”对话框。 图9 打开DICOM图像功能菜单 数据图像分为三种：解剖定位图像，功能图像和全脑扫描像。依次通过右侧“打开”按钮定位对应图像的路径。 图10 读取DICOM图像对话框 点击“OK”按钮读取图像，“Cancel”则取消读取。图像读取完毕后，软件界面左侧上方“数据管理器”中显出读入系统中的图像名称，左侧下方的“图像导航”中可以拖动滑动条浏览不同横断面、矢状面、冠状面和不同时刻的图像。对应的图像在右侧“显示”页面中绘制。如图11所示。 图11 图像数据管理和显示 注意三类图像都需要指定，如果缺少其中一种数据，则会提示图像读取错误。如下图所示： 图12 缺少图像数据错误 3）病人信息显示。图像文件读取完毕后，系统会显示相应的病人信息，主要包括病人姓名、ID、检查日期和检查描述。 2.2、计算激活图 1）打开“激活图”插件。点击程序界面工具栏右侧“激活图”插件按钮即可打开该插件页。 图13 fMRIAnalyze软件工具栏 激活图插件页面如下图所示。该页面由“激活图”和“病人信息”两个部分组成。其中，“病人信息”主要显示图像中的病人信息。 图14 激活图功能插件界面 点击该插件页面右上角“X即可关闭插件。 2）计算激活图。首先在“数据管理器”中选择功能图像，鼠标左键单击“FMRI_BOLD”选中功能图像，此时“激活图”插件中“请选择功能图像”提示消失，说明成功选中功能图像。然后，点击“计算激活图”按钮即可。 激活图计算完成后，“数据管理器”中生成新的功能图结点，并显示生成的激活图。效果如图。 图15 激活图效果显示（p=0.05） 3）调节激活图。调节前必须先计算激活图，如步骤2所述。然后可以通过调节统计p值的大小来调节激活图。通过拖动插件上的slider滑动条来调节p值，其调节范围为0.05-0.0001，调节过程中p值动态显示，并实时更新对应的激活图。 图16 拖动滑动条改变统计p值，生成新的激活图 注意，调节p值前必须先生成激活图，否则系统会提示用户首先计算激活图，如图17。 图17 未生成激活图错误 3、DICOM图像传输服务 1) 点击DICOM图像传输服务按钮，打开DICOM图像传输服务界面，如图18所示。 图18 DICOM图像传输服务按钮 点击按钮后，打开该控件的基本界面。界面分为上下两个部分，上部是DICOM图像服务控制，下部为图像发送控制。界面如下图所示。 图19 DICOM图像传输服务界面 3.1 DICOM图像传输服务控制 1）安装服务。 点击DICOM图像传输服务控制界面上“安装服务”按钮，安装成功后，系统提示“操作成功”，并且“启动服务”按钮和“卸载服务”变为激活状态。 2）启动服务。 首先设置服务参数，主要有两个参数，一是SCP端口号，用于与客户端SCU进行通信；二是数据库目录，即数据库文件的存储目录，同时该目录也是DICOM图像及其预览图的最终存储路径，分别对应该目录下的dicom和thumbs目录。 DICOM文件存储目录为DICOM图像的缓存路径，当图像被SCP接收后，首先存储到该路径下